More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0481 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0481  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
358 aa  713    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2570  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  73.46 
 
 
362 aa  517  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.968156  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1679  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  52.94 
 
 
362 aa  329  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.977341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.12 
 
 
367 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  36.12 
 
 
367 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.12 
 
 
367 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.64 
 
 
367 aa  162  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.12 
 
 
367 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
370 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.83 
 
 
366 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.94 
 
 
367 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1639  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25 
 
 
342 aa  122  7e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.22 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0761  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.09 
 
 
343 aa  111  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  26.62 
 
 
356 aa  109  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.68 
 
 
346 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.76 
 
 
369 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.45 
 
 
369 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.45 
 
 
369 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.99 
 
 
356 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.68 
 
 
369 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.15 
 
 
369 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  28.57 
 
 
368 aa  106  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0939  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.67 
 
 
345 aa  106  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.33 
 
 
366 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.68 
 
 
369 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  30.48 
 
 
380 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.68 
 
 
369 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.02 
 
 
343 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.85 
 
 
369 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.15 
 
 
368 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.85 
 
 
369 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.03 
 
 
345 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.42 
 
 
355 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1785  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.45 
 
 
341 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.6 
 
 
356 aa  100  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.16 
 
 
369 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2968  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.63 
 
 
326 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.708756  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4658  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.11 
 
 
327 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2289  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.97 
 
 
346 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.34 
 
 
347 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  26.18 
 
 
368 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  25.87 
 
 
368 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2150  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.82 
 
 
321 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.3 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.3 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  28.14 
 
 
372 aa  97.1  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  25.55 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  25.55 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1796  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  31.93 
 
 
324 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  25.55 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1904  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.93 
 
 
324 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.87 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.7 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  25.55 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2387  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  31.93 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.991592  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1900  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.68 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0133232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  25.55 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  26.46 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.7 
 
 
350 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1971  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.86 
 
 
321 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.64 
 
 
350 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1537  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.86 
 
 
321 aa  94  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.32 
 
 
371 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01302  L-Ala-D/L-Glu epimerase  30.86 
 
 
321 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0419339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.86 
 
 
321 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.131103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.7 
 
 
350 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1440  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.86 
 
 
321 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  25.77 
 
 
368 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01313  hypothetical protein  30.86 
 
 
321 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1796  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.86 
 
 
321 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.671548  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0594  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.27 
 
 
345 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25 
 
 
353 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2799  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.88 
 
 
326 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  25.52 
 
 
367 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25 
 
 
353 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1114  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.92 
 
 
356 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222874  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.4 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  25.32 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1555  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.48 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0801635 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1651  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain-containing protein  31.23 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0400124  hitchhiker  0.00630441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0148  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.77 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2300  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.47 
 
 
321 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.467318  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1559  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.47 
 
 
321 aa  90.5  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  22.3 
 
 
376 aa  90.1  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1469  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain protein  30.83 
 
 
321 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.79096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3635  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.15 
 
 
375 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1806  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain protein  30.83 
 
 
321 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.384509  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1805  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain protein  30.83 
 
 
321 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000648623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0823  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.45 
 
 
372 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.07 
 
 
362 aa  89.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3890  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.32 
 
 
342 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1867  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N- domain-containing protein  30.83 
 
 
321 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.17899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1408  muconate cycloisomerase  27.67 
 
 
371 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0829696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.18 
 
 
338 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1622  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.11 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.77 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408637  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.59 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>