69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2323 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2323  putative small heat shock protein  100 
 
 
100 aa  207  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.814003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1892  putative small heat shock protein  50.57 
 
 
99 aa  98.2  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.249328  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0687  putative small heat shock protein  41.18 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.115278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1810  hypothetical protein  42 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223334  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0688  putative small heat shock protein  37.18 
 
 
102 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.111955 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2444  putative heat shock protein  37.88 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  28.18 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  32.99 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  30.26 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  35.05 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  30.86 
 
 
176 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  32.99 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
176 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
174 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  47  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0010  heat shock protein HSP20  32.43 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  28.18 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  28.18 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  28.44 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2411  heat shock protein Hsp20  31 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 
171 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  31.31 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2458  heat shock protein Hsp20  31 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  26.26 
 
 
164 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  26.26 
 
 
164 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  34.83 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
175 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1648  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  29.09 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1594  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.386135 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1840  heat shock protein Hsp20  30.59 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  27.55 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  29.09 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  28.7 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  28.44 
 
 
132 aa  42.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1533  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.207706  normal  0.208575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  26.5 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  25.25 
 
 
139 aa  42  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3215  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0580949  hitchhiker  0.000000163698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  28.57 
 
 
121 aa  42  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 
171 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  28.71 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  28.71 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  32 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  28.71 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  27.68 
 
 
181 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  27.68 
 
 
181 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  28.71 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  28.7 
 
 
136 aa  40.8  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  28.71 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  28.71 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  28.71 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0472  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00129647  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  29.9 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10507  heat shock protein Hsp20/Hsp26, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10270)  27.27 
 
 
181 aa  40.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0988742 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 
130 aa  40.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  26.53 
 
 
138 aa  40.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  28.83 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  26.83 
 
 
162 aa  40  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  27.96 
 
 
143 aa  40  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  29.36 
 
 
153 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>