More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1658 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1658  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 95 aa  192  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0579498  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  59.14 
 
 		 90 aa  113  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  55.91 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  54.84 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  51.61 
 
 		 91 aa  103  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  47.31 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  47.13 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  46.59 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  40.86 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  43.18 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  46.59 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  42.17 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  43.37 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  43.68 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  45.98 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  44.16 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  41.11 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  38.2 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  38.2 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  44.74 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  43.18 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  42.53 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  43.02 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  38.64 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  37.78 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  38.04 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  41.03 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  46.67 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  44.57 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  36.67 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  37.08 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  41.3 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  41.46 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  42.67 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  42.67 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  38.89 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  38.89 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  42.05 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  38.64 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  43.75 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  40.23 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  38.89 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  40.7 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  40.23 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  44.05 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  44.05 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  36.78 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  40.22 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  40.91 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  40.23 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  40.23 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  40.23 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  40.23 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  40.23 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  41.38 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  42.31 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  39.08 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  41.38 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  41.38 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  41.56 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  36.05 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  38.82 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  41.38 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  39.08 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  42.31 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  38.46 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5974  thioredoxin domain protein  38.96 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.897668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  40.48 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  36.05 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  39.33 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  38.04 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  41.38 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  43.42 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  41.86 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  37.08 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  40.48 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  41.67 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  39.08 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  39.08 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  41.18 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  42.86 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  41.18 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  39.08 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  39.08 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  42.67 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  39.08 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  39.08 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  36.14 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  39.08 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  37.5 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  38.64 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  37.5 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  38.64 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  38.37 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  38.46 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  36.9 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  37.93 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  40.23 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  35.23 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  40.23 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>