More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0557 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
335 aa  677    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  86.89 
 
 
328 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  84.15 
 
 
328 aa  555  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  82.01 
 
 
328 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  77.68 
 
 
327 aa  498  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  48.02 
 
 
323 aa  299  6e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  47.26 
 
 
320 aa  291  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.92 
 
 
328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  48.04 
 
 
328 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.64 
 
 
318 aa  272  6e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  46.04 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.73 
 
 
320 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.73 
 
 
320 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.97 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  37.8 
 
 
326 aa  204  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.47 
 
 
337 aa  199  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.98 
 
 
349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.86 
 
 
327 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.03 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.84 
 
 
336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.97 
 
 
333 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.75 
 
 
345 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  25.79 
 
 
321 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  26.1 
 
 
317 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.85 
 
 
334 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  29.35 
 
 
321 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.63 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.85 
 
 
325 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  28.34 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.44 
 
 
327 aa  93.2  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.36 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  26.57 
 
 
342 aa  90.1  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  27.68 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.31 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  26.19 
 
 
317 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  26.88 
 
 
383 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  23.82 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.35 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  24.7 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  24.07 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.33 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  28.16 
 
 
289 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  24.32 
 
 
327 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  24.85 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  27.42 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  24.55 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  27.37 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.83 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  26.01 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  24.05 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  24.7 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  24.7 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  24.7 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  26.36 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  31.4 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  25.64 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.39 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  25.87 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  22.29 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.22 
 
 
343 aa  77  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  26.32 
 
 
339 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  28.36 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.41 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  24.91 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  25.78 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  25.26 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  25.26 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.26 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  24.07 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  22.43 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  22.87 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  27.86 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  30.73 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  24.84 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  29.73 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  24.84 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  27.31 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  26.28 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  24.84 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  27.78 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  31.41 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  27.67 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.6 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  25.4 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  24.83 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4257  Luciferase-like monooxygenase  24.85 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  24.76 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.57 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  26.09 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0856  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.51 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  29.9 
 
 
764 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  29.95 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  24.27 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  27.81 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  31.89 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.57 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  25.58 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  24.1 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3123  Luciferase-like monooxygenase  26.67 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  27.33 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>