More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5054 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4593  AMP-dependent synthetase and ligase  97.57 
 
 		 453 aa  852    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5054  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 453 aa  886    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.606706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0995  AMP-dependent synthetase and ligase  51.09 
 
 		 460 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5076  AMP-dependent synthetase and ligase  52.12 
 
 		 459 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6525  AMP-dependent synthetase and ligase  53.63 
 
 		 487 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6726  AMP-dependent synthetase and ligase  55.26 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149024  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1098  AMP-dependent synthetase and ligase  49.78 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3072  hypothetical protein  36.75 
 
 		 448 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0576  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 		 441 aa  217  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1373  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 		 383 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3107  Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II-like protein  37.08 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1323  acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II-like protein  34.17 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3063  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214783  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3791  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 446 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.636512 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1426  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.745476  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3967  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 		 447 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.923272  normal  0.0394514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1127  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3895  hypothetical protein  33.66 
 
 		 446 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 493 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 520 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4047  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 		 447 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 515 aa  97.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0813  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  28.84 
 
 		 541 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  28.84 
 
 		 541 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  28.84 
 
 		 541 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  28.84 
 
 		 541 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  28.84 
 
 		 541 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  28.84 
 
 		 555 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  29.04 
 
 		 555 aa  93.2  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  26.19 
 
 		 662 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  31.32 
 
 		 4575 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 512 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 513 aa  90.5  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  26.07 
 
 		 498 aa  89  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1255  AMP-dependent synthetase and ligase  27.85 
 
 		 506 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 549 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2677  AMP-dependent synthetase and ligase  43.09 
 
 		 544 aa  87.8  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1495  AMP-dependent synthetase and ligase  40.98 
 
 		 541 aa  86.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.98 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.98 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  28.12 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  28.12 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  28.12 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  29.43 
 
 		 4930 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 		 576 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3788  non-ribosomal peptide synthetase, putative  25.12 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0278843 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3218  AMP-dependent synthetase and ligase  24.89 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  25.93 
 
 		 554 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  25.6 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  27.14 
 
 		 5154 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  25.99 
 
 		 551 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  26.22 
 
 		 557 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 		 553 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  25.87 
 
 		 514 aa  83.2  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  26.61 
 
 		 552 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 578 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.4 
 
 		 572 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  25.42 
 
 		 559 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  26.93 
 
 		 541 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1153  AMP-dependent synthetase and ligase  28.36 
 
 		 535 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  25.28 
 
 		 559 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.83 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  27.25 
 
 		 522 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.83 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 502 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  33.15 
 
 		 588 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29237  predicted protein  30.98 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  26.72 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 		 528 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.18 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  25.57 
 
 		 559 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4677  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 		 507 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.65065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  29.41 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 		 559 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 568 aa  80.1  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 519 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  27.23 
 
 		 506 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  39.69 
 
 		 525 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.52 
 
 		 514 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  27.11 
 
 		 528 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  27.11 
 
 		 528 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  27.11 
 
 		 528 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  29.57 
 
 		 525 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.15 
 
 		 557 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  27.11 
 
 		 522 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 		 534 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 532 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.93 
 
 		 512 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  27.12 
 
 		 537 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  29.19 
 
 		 585 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  25.3 
 
 		 571 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 564 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 512 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0739056  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  40.16 
 
 		 535 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.15 
 
 		 563 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  27.11 
 
 		 528 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>