More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1752 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 
297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.2486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3075  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  72.38 
 
 
293 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.11788 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0479  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.07 
 
 
293 aa  414  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.778561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.07 
 
 
293 aa  414  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290033  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0511  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.51 
 
 
290 aa  403  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1440  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.98 
 
 
291 aa  399  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3121  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.07 
 
 
293 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2263  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.85 
 
 
305 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.85 
 
 
290 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1786  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.04 
 
 
292 aa  393  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2411  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.67 
 
 
290 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000385967  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.31 
 
 
289 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2896  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.67 
 
 
288 aa  388  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.257197 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1449  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.54 
 
 
291 aa  390  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.99 
 
 
296 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2829  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.67 
 
 
289 aa  384  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.07 
 
 
293 aa  386  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4056  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.64 
 
 
296 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.72 
 
 
291 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2342  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.76 
 
 
292 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.83 
 
 
292 aa  381  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3118  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.46 
 
 
290 aa  381  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.12 
 
 
292 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.07 
 
 
293 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.06 
 
 
298 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.54 
 
 
296 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.81 
 
 
293 aa  377  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 
294 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2858  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.19 
 
 
289 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0450568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.48 
 
 
292 aa  378  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.67 
 
 
293 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1798  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 
287 aa  378  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.25 
 
 
289 aa  378  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.310491  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  62.54 
 
 
289 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.06 
 
 
298 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 
294 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2889  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 
286 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.3 
 
 
297 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.06 
 
 
292 aa  374  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 
294 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0625  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.19 
 
 
290 aa  377  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.12 
 
 
292 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1998  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.45 
 
 
299 aa  374  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000687148  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2435  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.06 
 
 
294 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000704371 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2240  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.28 
 
 
305 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.68 
 
 
286 aa  375  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 
294 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1011  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.51 
 
 
292 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3186  glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase  63.48 
 
 
304 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0826  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.48 
 
 
291 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0797  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.48 
 
 
291 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1779  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.59 
 
 
293 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.149846  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0865  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.55 
 
 
294 aa  374  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000171087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0702  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 
307 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00504967  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15940  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.63 
 
 
293 aa  371  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2662  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.02 
 
 
289 aa  371  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2318  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.64 
 
 
297 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3386  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.28 
 
 
298 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1380  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.48 
 
 
286 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0762  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.06 
 
 
297 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.82 
 
 
358 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.34957 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.21 
 
 
296 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0208  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.64 
 
 
287 aa  368  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.76 
 
 
292 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 
289 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.11 
 
 
291 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.468388  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1470  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.96 
 
 
312 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1919  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 
298 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.9 
 
 
293 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.96 
 
 
297 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2131  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.07 
 
 
297 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.94 
 
 
297 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.96 
 
 
297 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1781  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.94 
 
 
298 aa  371  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000367124  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.96 
 
 
297 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3016  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.33 
 
 
289 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00414881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3019  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  58.68 
 
 
295 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.313086  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.35 
 
 
296 aa  367  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.942362  decreased coverage  0.00289209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6654  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.38 
 
 
292 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147178  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.34 
 
 
295 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1894  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 
292 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284713  normal  0.0266706 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01934  hypothetical protein  64.29 
 
 
270 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  57.97 
 
 
317 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.48 
 
 
292 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.9 
 
 
305 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.62 
 
 
297 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0879  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.62 
 
 
297 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5841  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 
286 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.99 
 
 
289 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1299  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.17 
 
 
291 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4022  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.42 
 
 
286 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.76 
 
 
291 aa  365  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001807  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.86 
 
 
293 aa  364  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1760  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.89 
 
 
298 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0453677 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3029  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 
291 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0478  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.02 
 
 
293 aa  364  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543511  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03410  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.38 
 
 
293 aa  363  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401967  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5902  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.63 
 
 
293 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1715  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.92 
 
 
297 aa  363  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.703429 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3052  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.07 
 
 
298 aa  363  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.664934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>