210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0725 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 
273 aa  556  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  45.56 
 
 
274 aa  244  8e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  42.11 
 
 
276 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2030  hypothetical protein  50.53 
 
 
248 aa  193  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2469  hypothetical protein  43.53 
 
 
252 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317526  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0707  hypothetical protein  45.26 
 
 
247 aa  187  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1592  hypothetical protein  43.87 
 
 
246 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.961862  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0863  hypothetical protein  41.81 
 
 
246 aa  185  6e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1462  hypothetical protein  44.92 
 
 
245 aa  185  6e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2165  hypothetical protein  44.16 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1083  hypothetical protein  40.95 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1460  hypothetical protein  41.6 
 
 
247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0386227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0737  hypothetical protein  44.92 
 
 
245 aa  182  7e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.542586  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1218  hypothetical protein  43.63 
 
 
245 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.982623 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2371  hypothetical protein  39.32 
 
 
252 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3261  hypothetical protein  49.43 
 
 
247 aa  175  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0043  hypothetical protein  43.16 
 
 
245 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0643  hypothetical protein  39.06 
 
 
248 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0788162  normal  0.017313 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_20  hypothetical protein  37.44 
 
 
434 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00632625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1577  hypothetical protein  39.15 
 
 
257 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0021  hypothetical protein  36.76 
 
 
250 aa  149  6e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195832  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0566  hypothetical protein  33.46 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00270463  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0020  hypothetical protein  37.25 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0870  hypothetical protein  35.18 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00543132  normal  0.0127443 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1362  hypothetical protein  35.68 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00740931  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0206  hypothetical protein  32.38 
 
 
251 aa  132  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1616  hypothetical protein  35.14 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00659965  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
333 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  52.83 
 
 
231 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  34.21 
 
 
347 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  39.08 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  36.23 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  37.35 
 
 
337 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  42.25 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  35.37 
 
 
351 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  40.85 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  32.14 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  41.94 
 
 
346 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  28.8 
 
 
350 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0608  Ion transport 2 domain protein  43.08 
 
 
135 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  37.5 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  55.81 
 
 
517 aa  55.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  31.33 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  35.11 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  34.52 
 
 
350 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  32.98 
 
 
128 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  33.73 
 
 
350 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  44.62 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  28.7 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  37.7 
 
 
79 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  33.73 
 
 
350 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  32.26 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  37.04 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  34.83 
 
 
371 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  54.76 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  58.54 
 
 
263 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  38.16 
 
 
334 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  38.16 
 
 
334 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  36.23 
 
 
228 aa  52.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  37.88 
 
 
341 aa  52.4  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  30.85 
 
 
244 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  32.22 
 
 
131 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  38.16 
 
 
146 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  35.62 
 
 
325 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  40 
 
 
346 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  38.36 
 
 
331 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43530  predicted protein  32.38 
 
 
356 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  40.58 
 
 
330 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  42.03 
 
 
335 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  43.55 
 
 
391 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  40.58 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  40.58 
 
 
330 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  32.14 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  35.62 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  43.55 
 
 
391 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  36.76 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  37.68 
 
 
330 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  43.55 
 
 
391 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0094  Ion transport 2 domain protein  37.74 
 
 
67 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  40.58 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 
335 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  40.58 
 
 
330 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  37.88 
 
 
336 aa  50.8  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 
335 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  48.89 
 
 
269 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43171  predicted protein  35.71 
 
 
448 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899265  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  36.67 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  32.69 
 
 
376 aa  50.1  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  48.89 
 
 
271 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  38.96 
 
 
331 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  37.93 
 
 
359 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  45.1 
 
 
352 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4630  hypothetical protein  42.11 
 
 
114 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000696227  hitchhiker  0.00000000000143872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  37.04 
 
 
262 aa  48.9  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  46.94 
 
 
393 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  35.71 
 
 
376 aa  48.1  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 
376 aa  48.5  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  51.22 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  38.46 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>