More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2971 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  100 
 
 		 610 aa  1230    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  33.69 
 
 		 592 aa  301  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  33.13 
 
 		 613 aa  261  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  34.34 
 
 		 606 aa  256  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  32.35 
 
 		 676 aa  253  6e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  32.68 
 
 		 649 aa  249  8e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3122  ABC transporter-like protein protein  32.44 
 
 		 609 aa  246  6e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  34.12 
 
 		 610 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.45 
 
 		 578 aa  244  5e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.27 
 
 		 566 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  31.99 
 
 		 600 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  47.48 
 
 		 591 aa  240  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  38.08 
 
 		 578 aa  240  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  30.35 
 
 		 566 aa  239  8e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.75 
 
 		 578 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.75 
 
 		 578 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  32.96 
 
 		 550 aa  238  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  31.18 
 
 		 597 aa  237  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.18 
 
 		 597 aa  236  7e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  35.12 
 
 		 598 aa  236  7e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  33.54 
 
 		 613 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  32.81 
 
 		 566 aa  234  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  30.89 
 
 		 584 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  32.02 
 
 		 632 aa  233  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.65 
 
 		 1018 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  34.18 
 
 		 597 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  29.89 
 
 		 586 aa  232  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  31.68 
 
 		 639 aa  231  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.39 
 
 		 586 aa  230  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  47.06 
 
 		 633 aa  230  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.45 
 
 		 582 aa  230  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  31.14 
 
 		 606 aa  230  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.79 
 
 		 586 aa  230  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  30.2 
 
 		 577 aa  229  8e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  34.35 
 
 		 746 aa  229  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  33.2 
 
 		 620 aa  229  9e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.32 
 
 		 586 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.32 
 
 		 586 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.32 
 
 		 586 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  46.44 
 
 		 602 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  35.68 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 613 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2900  ABC transporter-like protein protein  41.61 
 
 		 749 aa  228  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0999643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.2 
 
 		 586 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  31.79 
 
 		 607 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  28.62 
 
 		 586 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  33.76 
 
 		 598 aa  229  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  29.15 
 
 		 586 aa  228  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.15 
 
 		 586 aa  228  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.32 
 
 		 589 aa  228  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.59 
 
 		 1024 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  30.69 
 
 		 611 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  29.76 
 
 		 598 aa  227  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  30.92 
 
 		 556 aa  227  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.79 
 
 		 586 aa  226  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  30.38 
 
 		 616 aa  226  9e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.66 
 
 		 579 aa  226  9e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  31.22 
 
 		 634 aa  226  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  35.29 
 
 		 605 aa  226  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.59 
 
 		 1018 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 		 619 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  31.58 
 
 		 575 aa  226  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  38.01 
 
 		 617 aa  225  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  32.69 
 
 		 611 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.5 
 
 		 611 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  29.09 
 
 		 596 aa  225  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  27.53 
 
 		 600 aa  224  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  47.9 
 
 		 601 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  30.86 
 
 		 575 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.64 
 
 		 597 aa  224  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  31.15 
 
 		 613 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  44.87 
 
 		 589 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  47.9 
 
 		 601 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.07 
 
 		 575 aa  224  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  33.57 
 
 		 583 aa  224  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  29.09 
 
 		 588 aa  224  4.9999999999999996e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  31.12 
 
 		 647 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  32.38 
 
 		 1018 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  29.76 
 
 		 581 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  47.26 
 
 		 601 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  48.32 
 
 		 727 aa  223  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  30.66 
 
 		 608 aa  223  6e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  31.75 
 
 		 612 aa  223  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  45.34 
 
 		 603 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.9 
 
 		 588 aa  223  9e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  39.65 
 
 		 651 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  29.57 
 
 		 564 aa  223  9.999999999999999e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  32.5 
 
 		 611 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  39.88 
 
 		 571 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  29.46 
 
 		 601 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  31.77 
 
 		 609 aa  222  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  28.73 
 
 		 600 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 620 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  27.59 
 
 		 599 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  47.23 
 
 		 578 aa  221  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  47.23 
 
 		 578 aa  221  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0275  ABC transporter related protein  32.92 
 
 		 651 aa  221  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  29.43 
 
 		 572 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.37 
 
 		 1006 aa  221  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.18 
 
 		 1008 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>