75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1043 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  100 
 
 		 337 aa  679    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0864  hydrolase  44.24 
 
 		 314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.020243  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0269  hypothetical protein  28.48 
 
 		 298 aa  96.3  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2835  hypothetical protein  30.28 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0510204 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0286  hypothetical protein  32.35 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  27.39 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  25.1 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  27.81 
 
 		 645 aa  57  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  25.85 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.96 
 
 		 645 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  26.69 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.34 
 
 		 645 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  29.73 
 
 		 467 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  29.32 
 
 		 402 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.54 
 
 		 645 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  25.29 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.42 
 
 		 645 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  23.4 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  23.4 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  23.4 
 
 		 284 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  23.4 
 
 		 284 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  23.4 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  23.4 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8503  putative lipoprotein  28.29 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  25.5 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  30.28 
 
 		 259 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.46 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  22.98 
 
 		 284 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  22.98 
 
 		 284 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  26.53 
 
 		 381 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5534  hypothetical protein  31.58 
 
 		 390 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  32.48 
 
 		 424 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.1 
 
 		 659 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  26.09 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  26.64 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.56 
 
 		 629 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  30.25 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  22.98 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  24.1 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  33.33 
 
 		 490 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  24.58 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1326  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  22.97 
 
 		 277 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  23.08 
 
 		 290 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  22.43 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  25.5 
 
 		 335 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  24.52 
 
 		 355 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  23.5 
 
 		 345 aa  46.2  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  28.93 
 
 		 866 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  26.41 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  26.82 
 
 		 442 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  19.56 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  29.63 
 
 		 474 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  31.06 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  20.4 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  25.24 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  30.6 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  28.57 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  27.52 
 
 		 246 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  24.24 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  25.69 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  28.26 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  30.28 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  24.81 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  25.32 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  34.94 
 
 		 385 aa  43.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5039  hypothetical protein  30.84 
 
 		 252 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00504479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  28.87 
 
 		 258 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.66 
 
 		 644 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  30 
 
 		 326 aa  42.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  28.57 
 
 		 876 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 297 aa  42.7  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  26.58 
 
 		 649 aa  42.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  28.87 
 
 		 258 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2224  hypothetical protein  26.27 
 
 		 267 aa  42.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>