More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0321 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  100 
 
 		 753 aa  1510    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  32.02 
 
 		 716 aa  340  5e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  32.14 
 
 		 740 aa  335  1e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  30.27 
 
 		 770 aa  333  9e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 		 764 aa  332  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  31.69 
 
 		 725 aa  332  2e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  31.74 
 
 		 792 aa  324  3e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 		 773 aa  318  3e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  31.35 
 
 		 745 aa  309  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 		 786 aa  307  5.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 		 820 aa  273  9e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  36.24 
 
 		 641 aa  264  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  34.75 
 
 		 465 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  35.07 
 
 		 473 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  35.15 
 
 		 474 aa  233  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  36.77 
 
 		 479 aa  230  7e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  35.54 
 
 		 475 aa  225  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 796 aa  180  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  30.47 
 
 		 518 aa  159  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  30.2 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1905  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 812 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  29.47 
 
 		 471 aa  151  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 		 471 aa  151  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  29.78 
 
 		 471 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  29.78 
 
 		 471 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  29.78 
 
 		 471 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  29.78 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  29.78 
 
 		 471 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  29.78 
 
 		 471 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  30.02 
 
 		 471 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  29.71 
 
 		 471 aa  149  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  29.07 
 
 		 488 aa  147  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  30.17 
 
 		 460 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  29.66 
 
 		 462 aa  147  8.000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 		 506 aa  145  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 490 aa  145  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 495 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  28.92 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.27 
 
 		 489 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  29.4 
 
 		 467 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  29.05 
 
 		 467 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.82 
 
 		 467 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.82 
 
 		 467 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 495 aa  137  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 		 494 aa  137  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.82 
 
 		 467 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  28.82 
 
 		 467 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  28.82 
 
 		 467 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  27.49 
 
 		 471 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  28.86 
 
 		 491 aa  136  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  27.7 
 
 		 471 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  27.7 
 
 		 471 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  27.7 
 
 		 471 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.45 
 
 		 500 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  29.84 
 
 		 474 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  28.82 
 
 		 467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  28.6 
 
 		 497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  28.99 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 486 aa  132  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  27.95 
 
 		 463 aa  132  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  27.95 
 
 		 463 aa  132  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  29.05 
 
 		 467 aa  132  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  30.08 
 
 		 439 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 		 538 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  27.67 
 
 		 471 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 476 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 495 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  29.3 
 
 		 501 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  27.49 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  27.01 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  27.25 
 
 		 495 aa  129  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 463 aa  128  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.07 
 
 		 471 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 		 481 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.07 
 
 		 471 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  28.97 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  29.37 
 
 		 463 aa  128  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.33 
 
 		 471 aa  128  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.56 
 
 		 471 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  26.76 
 
 		 471 aa  127  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 449 aa  127  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 467 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 481 aa  127  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  28.29 
 
 		 460 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  29.2 
 
 		 456 aa  127  8.000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 494 aa  127  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 475 aa  126  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 482 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  27.39 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 		 566 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  30.89 
 
 		 500 aa  124  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 504 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 506 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26.12 
 
 		 483 aa  123  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.97 
 
 		 467 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 488 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>