50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf874 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  100 
 
 
314 aa  657    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  43.82 
 
 
614 aa  199  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  41.6 
 
 
617 aa  188  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  40.93 
 
 
539 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  40.08 
 
 
538 aa  175  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  41.48 
 
 
365 aa  123  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  36.47 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  28.27 
 
 
1310 aa  93.2  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  28.98 
 
 
341 aa  89  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  35.22 
 
 
272 aa  86.3  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  34.57 
 
 
308 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  27.44 
 
 
466 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  31.46 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  33.54 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  27.84 
 
 
1346 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  28 
 
 
256 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  27.61 
 
 
596 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  32.95 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  31.68 
 
 
1503 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  33.54 
 
 
542 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  34.94 
 
 
539 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  26.91 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  30.95 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  30.95 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  33.53 
 
 
553 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  30.95 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  30.95 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  26.71 
 
 
657 aa  70.5  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  31.1 
 
 
558 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  31.1 
 
 
558 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  31.58 
 
 
516 aa  69.7  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  28.27 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  30.12 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  23.08 
 
 
232 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  29.53 
 
 
323 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  27.46 
 
 
219 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0769  deoxyribonuclease I  26.32 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000516595  unclonable  0.0000000197257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  27.63 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  28.1 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  28.1 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0833  endonuclease I  26.9 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3377  endonuclease I  25.56 
 
 
235 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02775  DNA-specific endonuclease I  25.56 
 
 
235 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.153052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02738  hypothetical protein  25.56 
 
 
235 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3288  endonuclease I  25.56 
 
 
235 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.961762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3103  endonuclease I  25.56 
 
 
235 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3087  endonuclease I  25.56 
 
 
235 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00686191  hitchhiker  0.0000298257 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0750  Deoxyribonuclease I  25.56 
 
 
235 aa  42.7  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4248  endonuclease I  25.56 
 
 
235 aa  42.7  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.260828 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0842  deoxyribonuclease I  26.57 
 
 
258 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000267909  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>