More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01322 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01322  Patatin  100 
 
 		 296 aa  612  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1205  patatin  58.21 
 
 		 279 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0115  patatin  34.71 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0045028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0310  hypothetical protein  31.06 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.544129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1912  patatin  29.55 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3038  putative exported phospholipase, patatin-like  29.34 
 
 		 274 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000229451  unclonable  0.00000199426 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  29.83 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  29.37 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  29.37 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  29.24 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  29.24 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  29.24 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  29.24 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  29.24 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  24.45 
 
 		 339 aa  95.9  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  32.95 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  33.7 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  34.18 
 
 		 349 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  33.54 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  33.91 
 
 		 311 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  34.18 
 
 		 358 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  33.54 
 
 		 358 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  34.18 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  29.37 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  33.54 
 
 		 474 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  33.54 
 
 		 347 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  34.39 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  33.54 
 
 		 347 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  33.54 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  33.56 
 
 		 223 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  34.18 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  29.04 
 
 		 321 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  36.02 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  33.54 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  32.47 
 
 		 310 aa  85.5  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  33.54 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  32.91 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  32.91 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  32.91 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  34.57 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  26.82 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  33.54 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  32.91 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  33.11 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  31.14 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  25.48 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  33.11 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  24.84 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  26.03 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  34.81 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  31.25 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  30.38 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  31.18 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  28.35 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  31.17 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  30.91 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3042  patatin  30.27 
 
 		 586 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  30.19 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  28.48 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  29.1 
 
 		 751 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  30.43 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  29.1 
 
 		 728 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  29.1 
 
 		 728 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0062  hypothetical protein  29.17 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.968802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  28.72 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0819  alpha-beta hydrolase superfamily esterase  25.86 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  30.59 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  32.24 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  31.65 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  31.48 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  31.36 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  27.5 
 
 		 727 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  28.57 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  31.33 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  29.75 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.01 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  26.1 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  28.93 
 
 		 720 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  29.87 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  28.84 
 
 		 767 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  27.23 
 
 		 667 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  30.63 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  27.35 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  28.48 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  26.51 
 
 		 803 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1726  patatin  26.67 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0620011  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  26.51 
 
 		 803 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  26.51 
 
 		 803 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  29.79 
 
 		 733 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  30 
 
 		 728 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  26.57 
 
 		 748 aa  68.9  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  29.75 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  28.03 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  32.37 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  30.52 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  23.69 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  30.52 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  27.36 
 
 		 728 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  29.63 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  27 
 
 		 728 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>