More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01177 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  100 
 
 
497 aa  1030    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  41.28 
 
 
475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  42.55 
 
 
491 aa  350  4e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  38.63 
 
 
497 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.67 
 
 
491 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.67 
 
 
491 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.02 
 
 
491 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.93 
 
 
491 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.82 
 
 
491 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.51 
 
 
490 aa  299  7e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.15 
 
 
488 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.15 
 
 
489 aa  292  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.87 
 
 
496 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.75 
 
 
490 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.66 
 
 
496 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.66 
 
 
497 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.48 
 
 
490 aa  289  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  35.08 
 
 
489 aa  289  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  37.69 
 
 
484 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.48 
 
 
490 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.48 
 
 
490 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  36.48 
 
 
490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.48 
 
 
490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.48 
 
 
490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  35.97 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.27 
 
 
490 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.13 
 
 
491 aa  282  8.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.86 
 
 
491 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  34.4 
 
 
495 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  34.19 
 
 
495 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  33.97 
 
 
496 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  36.49 
 
 
489 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  34.7 
 
 
470 aa  262  8e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  34.03 
 
 
498 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  33.89 
 
 
498 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  34.03 
 
 
498 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  33.82 
 
 
498 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  35.22 
 
 
459 aa  252  9.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  33.91 
 
 
459 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  33.84 
 
 
492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05449  molybdenum transporter ATP-binding subunit modF  51.89 
 
 
198 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  29.8 
 
 
499 aa  202  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  32.96 
 
 
413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  30.43 
 
 
482 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  29.85 
 
 
497 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  28.99 
 
 
500 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  27.59 
 
 
562 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  27.67 
 
 
636 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  26.46 
 
 
501 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  27.67 
 
 
494 aa  130  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.47 
 
 
263 aa  125  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  33.63 
 
 
260 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  28.69 
 
 
479 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  34.47 
 
 
280 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  22.7 
 
 
514 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  30.94 
 
 
275 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  27.96 
 
 
478 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  34.55 
 
 
260 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  34.55 
 
 
260 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  33.49 
 
 
275 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  28.96 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  23.03 
 
 
500 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  33.2 
 
 
271 aa  110  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  25.05 
 
 
501 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 
275 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  30.28 
 
 
262 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  31.31 
 
 
269 aa  107  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  31.07 
 
 
336 aa  106  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  31.63 
 
 
266 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  32.35 
 
 
272 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  30.26 
 
 
271 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  27.98 
 
 
261 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  30.63 
 
 
260 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  29.7 
 
 
250 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49011  predicted protein  25.28 
 
 
541 aa  101  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  28.96 
 
 
269 aa  101  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  31.75 
 
 
263 aa  101  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  30.77 
 
 
262 aa  100  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  32.04 
 
 
267 aa  99.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  28.38 
 
 
265 aa  99  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45404  predicted protein  23.62 
 
 
635 aa  98.2  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  28.99 
 
 
260 aa  97.1  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  29.02 
 
 
239 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  29.52 
 
 
265 aa  96.3  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1150  ABC transporter related  26.17 
 
 
272 aa  96.3  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660003  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  27.56 
 
 
287 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  26.82 
 
 
263 aa  96.3  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  26.91 
 
 
264 aa  95.1  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  27.03 
 
 
274 aa  93.6  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  23.2 
 
 
568 aa  93.6  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  29.25 
 
 
264 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0295  ABC transporter related  30 
 
 
249 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.333842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  27.4 
 
 
259 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  27.4 
 
 
259 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  27.27 
 
 
270 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3446  ABC transporter related  32.93 
 
 
620 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.055391  normal  0.816611 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  25.98 
 
 
260 aa  91.3  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  27.65 
 
 
259 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  23.9 
 
 
648 aa  90.9  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  23.2 
 
 
568 aa  90.1  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>