154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4272 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 
203 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  81.38 
 
 
189 aa  320  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  81.38 
 
 
189 aa  320  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  78.61 
 
 
189 aa  298  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  66.85 
 
 
208 aa  248  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  66.3 
 
 
208 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  65.75 
 
 
192 aa  241  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  68.89 
 
 
189 aa  240  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  56.76 
 
 
196 aa  213  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  60 
 
 
181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  59.66 
 
 
182 aa  212  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  59.32 
 
 
193 aa  209  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  56.22 
 
 
206 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  56.59 
 
 
201 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  55.19 
 
 
224 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  59.77 
 
 
185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  53.67 
 
 
205 aa  197  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  53.98 
 
 
205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  54.4 
 
 
208 aa  196  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  55.49 
 
 
206 aa  185  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  52.75 
 
 
202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  57.87 
 
 
184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  58.52 
 
 
184 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  55.37 
 
 
184 aa  177  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.59 
 
 
192 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.03 
 
 
204 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  46.39 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  46.63 
 
 
258 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  46.6 
 
 
207 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  46.6 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  46.6 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.67 
 
 
209 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.4 
 
 
192 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  47.24 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.89 
 
 
190 aa  131  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.57 
 
 
216 aa  131  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.24 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.71 
 
 
187 aa  124  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.68 
 
 
190 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.5 
 
 
199 aa  122  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.83 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.24 
 
 
196 aa  117  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  48.34 
 
 
197 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.57 
 
 
216 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  39.7 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  39.7 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  39.7 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  39.7 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.96 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  39.7 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  39.2 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  39.7 
 
 
205 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  39.2 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.49 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.3 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.86 
 
 
201 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  39.25 
 
 
213 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.33 
 
 
215 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.25 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  38.19 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.64 
 
 
214 aa  111  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  39.2 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  38.71 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.14 
 
 
220 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.78 
 
 
201 aa  108  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.55 
 
 
206 aa  108  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.17 
 
 
208 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.59 
 
 
194 aa  106  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  38 
 
 
211 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.05 
 
 
212 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  36.36 
 
 
204 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.27 
 
 
234 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  41.04 
 
 
168 aa  105  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.92 
 
 
196 aa  104  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.72 
 
 
207 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  38.59 
 
 
203 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  34.81 
 
 
180 aa  102  3e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.16 
 
 
201 aa  102  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  36.82 
 
 
217 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0224  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.46 
 
 
262 aa  101  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.03 
 
 
212 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4972  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.51 
 
 
213 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537509  normal  0.124198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.99 
 
 
230 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.38 
 
 
213 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.85 
 
 
224 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  31.44 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.03 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.61 
 
 
217 aa  98.2  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  35.84 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  34.09 
 
 
170 aa  97.1  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.02 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.38 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.24 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.46 
 
 
240 aa  95.1  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.24 
 
 
212 aa  94.7  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.72 
 
 
207 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  33.5 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01450  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.62 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.79 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0157  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.67 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.798535 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>