More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0237 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0237  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0171  triosephosphate isomerase  63.75 
 
 		 256 aa  342  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000459536  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  42.68 
 
 		 252 aa  212  5.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  42.51 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0239  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000101955  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 275 aa  204  8e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  39.36 
 
 		 254 aa  204  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  40.49 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  41.04 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  41.3 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  40.64 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  40.64 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  41.04 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  40.64 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  39.84 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  40.73 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1652  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  40.73 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  38.55 
 
 		 252 aa  198  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  41.53 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  41.9 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  41.9 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  41.04 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  39.68 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  38.98 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  39.61 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  41.49 
 
 		 646 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  37.05 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  38.49 
 
 		 251 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  37.8 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  42.11 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  40 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  38.71 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  38.25 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  38.96 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  38.4 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  39.2 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  40.24 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  40.5 
 
 		 255 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  39.68 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  37.4 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  35.71 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  38.96 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  38.49 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  36.65 
 
 		 251 aa  188  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 		 262 aa  188  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  40.32 
 
 		 248 aa  188  9e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  39.22 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  38.96 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  38.15 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  38.55 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  37.5 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  36.61 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  38.58 
 
 		 263 aa  184  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  37.55 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  37.8 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  38.15 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  36.65 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  36.69 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  36.82 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  38.19 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  39.68 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  36.69 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  40.87 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  37.65 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0891  triosephosphate isomerase  36.82 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  39.68 
 
 		 650 aa  182  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0742  triosephosphate isomerase  41.04 
 
 		 256 aa  181  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  36.72 
 
 		 261 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  37.45 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  40.96 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  36.18 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0750  triosephosphate isomerase  40 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  37.9 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  37.25 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  35.2 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  38.89 
 
 		 252 aa  179  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  38.46 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  38.19 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  39.59 
 
 		 655 aa  179  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  38.55 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  37.6 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  36.14 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  37.35 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  35.25 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  37.7 
 
 		 687 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  37.75 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  38 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  36.8 
 
 		 261 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>