More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0239 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0239  triosephosphate isomerase  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000101955  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1652  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 
257 aa  245  6e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 
252 aa  231  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  46 
 
 
253 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 
252 aa  226  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0171  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 
256 aa  223  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000459536  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  45.12 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 
251 aa  218  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 
251 aa  218  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  41.87 
 
 
251 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 
251 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  42.68 
 
 
251 aa  217  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 
251 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 
251 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 
251 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 
251 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 
251 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  42.68 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  41.3 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  39.68 
 
 
252 aa  208  8e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0237  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 
259 aa  207  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  40.96 
 
 
251 aa  202  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  42.98 
 
 
255 aa  202  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  41.11 
 
 
253 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  41.11 
 
 
253 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  41.46 
 
 
251 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  43.09 
 
 
252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 
251 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  41.9 
 
 
253 aa  195  7e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  39.84 
 
 
250 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  41.46 
 
 
251 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  39.2 
 
 
251 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  42.13 
 
 
252 aa  190  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0693  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 
257 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.444699  unclonable  0.0000000042345 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  41.06 
 
 
248 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 
249 aa  188  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 
250 aa  188  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  41.94 
 
 
253 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  40.65 
 
 
250 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  39.84 
 
 
256 aa  186  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  39.43 
 
 
257 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  39.84 
 
 
250 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 
248 aa  185  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  39.84 
 
 
251 aa  185  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  40.89 
 
 
250 aa  184  9e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  37.6 
 
 
655 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 
256 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  39.84 
 
 
251 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  38.43 
 
 
275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  40.08 
 
 
646 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  39.84 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  41.9 
 
 
241 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 
250 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  37.1 
 
 
252 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  38.62 
 
 
254 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 
251 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  38.52 
 
 
250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  37.1 
 
 
249 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  40.62 
 
 
256 aa  178  5.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  38.62 
 
 
250 aa  178  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  39.2 
 
 
251 aa  178  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  38.87 
 
 
249 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  38.49 
 
 
257 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  36.26 
 
 
261 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 
254 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  38.35 
 
 
261 aa  175  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  40.08 
 
 
252 aa  175  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  43.9 
 
 
243 aa  175  7e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  39.51 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  40.57 
 
 
654 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  37.8 
 
 
650 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  39.11 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  36.09 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  38.87 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  38.21 
 
 
250 aa  172  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2499  triosephosphate isomerase  43.1 
 
 
230 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3615  Triose-phosphate isomerase  43.1 
 
 
230 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  39.1 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  37.93 
 
 
262 aa  172  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  36.29 
 
 
261 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  38.49 
 
 
257 aa  171  7.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  43.07 
 
 
243 aa  171  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  40.72 
 
 
240 aa  171  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  38.21 
 
 
250 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  39.84 
 
 
256 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  39.92 
 
 
251 aa  170  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  39.58 
 
 
243 aa  169  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  36.61 
 
 
260 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  38.4 
 
 
253 aa  169  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  38.72 
 
 
261 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  35.41 
 
 
260 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  37.55 
 
 
261 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  35.77 
 
 
248 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  35.77 
 
 
248 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  37.6 
 
 
251 aa  169  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  36.84 
 
 
261 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  36.84 
 
 
261 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  39.3 
 
 
256 aa  168  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  36.84 
 
 
261 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0750  triosephosphate isomerase  37.4 
 
 
248 aa  168  8e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>