More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1434 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
445 aa  919    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  98.65 
 
 
458 aa  908    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  44.42 
 
 
462 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  46.74 
 
 
480 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  45.43 
 
 
475 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  37.32 
 
 
483 aa  249  5e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  38.95 
 
 
396 aa  249  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  39.12 
 
 
396 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  38.67 
 
 
396 aa  233  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.98 
 
 
395 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  32.99 
 
 
477 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.43 
 
 
395 aa  226  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.11 
 
 
420 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  33.51 
 
 
419 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  32.07 
 
 
480 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  35.11 
 
 
420 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.5 
 
 
478 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  34.2 
 
 
502 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  34.47 
 
 
436 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.38 
 
 
420 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.66 
 
 
485 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.23 
 
 
392 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.77 
 
 
541 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.77 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.59 
 
 
481 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  32.45 
 
 
502 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0557  cardiolipin synthetase  36.46 
 
 
514 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  33.87 
 
 
537 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.11 
 
 
482 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0887  phospholipase D/transphosphatidylase  36.61 
 
 
426 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4096  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.43 
 
 
413 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  32.89 
 
 
478 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  30.4 
 
 
478 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  32.09 
 
 
446 aa  206  9e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  30.52 
 
 
478 aa  206  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  29.76 
 
 
514 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.71 
 
 
477 aa  204  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.95 
 
 
474 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  29.55 
 
 
514 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.95 
 
 
374 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  32.53 
 
 
479 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  32.27 
 
 
479 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.44 
 
 
474 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  29.34 
 
 
514 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  29.34 
 
 
514 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  32.98 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  29.3 
 
 
514 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  29.34 
 
 
514 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  29.34 
 
 
514 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  29.34 
 
 
514 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  33.89 
 
 
485 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  33.52 
 
 
417 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  32.71 
 
 
499 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  30.99 
 
 
483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 
483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  32.61 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.12 
 
 
514 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  34.34 
 
 
417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  35.11 
 
 
412 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  29.51 
 
 
514 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  29.34 
 
 
514 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  32.09 
 
 
479 aa  199  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  29.43 
 
 
480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  32.81 
 
 
479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.06 
 
 
453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  32.01 
 
 
479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  32.01 
 
 
479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  32.01 
 
 
479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  32.01 
 
 
479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  32.01 
 
 
479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0679  phospholipase D/transphosphatidylase  35.39 
 
 
466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  32.01 
 
 
479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  32.91 
 
 
484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  33.16 
 
 
484 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  32.01 
 
 
479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.99 
 
 
479 aa  197  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  30.81 
 
 
491 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  32.59 
 
 
406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  32.53 
 
 
479 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  32.53 
 
 
479 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.11 
 
 
492 aa  196  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  30.1 
 
 
473 aa  195  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.12 
 
 
483 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  32.81 
 
 
479 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  31.2 
 
 
479 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  30.55 
 
 
483 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  30.94 
 
 
502 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  31.68 
 
 
484 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  32.2 
 
 
487 aa  193  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  33.51 
 
 
479 aa  193  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  31.88 
 
 
486 aa  192  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  32.12 
 
 
479 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  31.09 
 
 
470 aa  192  9e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.83 
 
 
472 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  30.29 
 
 
476 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.61 
 
 
432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0415723  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  30.69 
 
 
474 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1712  phospholipase D/transphosphatidylase  34.37 
 
 
545 aa  190  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  32.28 
 
 
479 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.05 
 
 
476 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>