More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4311 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4311  putative metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 408 aa  808    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2773  hypothetical protein  40.53 
 
 		 409 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804833  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2647  metal dependent phosphohydrolase  34.13 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.427362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1357  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1003  putative metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4051  HD-GYP domain-containing protein  31.15 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0489  HD-GYP domain-containing protein  32.27 
 
 		 402 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4666  putative metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2795  hypothetical protein  34.66 
 
 		 331 aa  136  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0373  putative metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2693  HD-GYP domain-containing protein  33.33 
 
 		 319 aa  123  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0258  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4783  putative metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 		 329 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0983875  normal  0.561862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1852  putative metal dependent phosphohydrolase  34.96 
 
 		 349 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3466  putative metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 		 330 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2242  putative metal dependent phosphohydrolase  33.19 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2752  putative metal dependent phosphohydrolase  33.19 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  30.17 
 
 		 421 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 420 aa  99.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 		 375 aa  99.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  26.22 
 
 		 352 aa  99.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 		 441 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  27.53 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 		 419 aa  96.7  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  30.17 
 
 		 420 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  29.61 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 		 435 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  23.98 
 
 		 395 aa  94  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  31.84 
 
 		 417 aa  94  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  23.33 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 		 421 aa  89  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  28.69 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  25.71 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  27.66 
 
 		 426 aa  86.3  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  30.74 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  27.05 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  27.01 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  25.37 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  26.61 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  30.88 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  25.1 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  29.19 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  26.72 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  27.51 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  26.94 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  26.26 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  28.57 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3572  metal dependent phosphohydrolase  27.81 
 
 		 516 aa  80.5  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  28.81 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 		 446 aa  79.7  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  36.16 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  25.4 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  26.05 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  29.68 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  26.25 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  23.81 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  27.9 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  22.27 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0563  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  26.92 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  22.91 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  23.45 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  22.44 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1256  HD domain-containing protein  24.12 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0488462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  24.66 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  27.72 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3058  metal dependent phosphohydrolase  27.16 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  27.14 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  22.73 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  29.19 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>