More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1252 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  49.75 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  57.36 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  51.98 
 
 		 209 aa  208  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  50.77 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  54.59 
 
 		 198 aa  191  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  49.75 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  48.48 
 
 		 167 aa  182  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  45.69 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  45.83 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  45.13 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  42.56 
 
 		 200 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  45.64 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  45.13 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  42.56 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  41.95 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  40 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  39.6 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  37.44 
 
 		 197 aa  142  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  39.8 
 
 		 194 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  37.76 
 
 		 194 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  37.56 
 
 		 200 aa  131  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  32.82 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  32.82 
 
 		 199 aa  124  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  36.55 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  33.17 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  30.26 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  30.26 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  32.18 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  27.36 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  40.31 
 
 		 149 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  32.95 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  28.71 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  33.53 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  36.09 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  32.61 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  35.07 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  34.07 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  31.53 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  33.84 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  30.57 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  29.95 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  30.45 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  26.8 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  35.03 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  31.37 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  34.16 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  29.94 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  29.03 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  39.25 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  35.09 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  30.6 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  22.82 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.69 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  29.23 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  34.87 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 290 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  28.74 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  26.88 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  30 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  27.75 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  30.61 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  32.67 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  33.91 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1167  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.88 
 
 		 259 aa  52.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000217887  hitchhiker  0.00731668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4060  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 278 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  33.91 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  33.91 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  33.91 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  33.91 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  33.91 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  26.46 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  30.26 
 
 		 174 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>