65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1463 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1463  restriction endonuclease  100 
 
 		 991 aa  2045    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1019  type III restriction-modification system enzyme, R subunit  55.42 
 
 		 987 aa  1105    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0398  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  55.34 
 
 		 989 aa  1088    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982266  hitchhiker  7.86285e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0453  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  55.34 
 
 		 989 aa  1088    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985709  hitchhiker  1.2237e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0411  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  55.24 
 
 		 989 aa  1085    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.63396  hitchhiker  0.00000141502 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0393  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  55.14 
 
 		 989 aa  1085    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00360009  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0390  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  55.34 
 
 		 989 aa  1086    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264054  hitchhiker  1.42432e-23 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0518  type III restriction enzyme, res subunit  26.61 
 
 		 991 aa  218  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0515  type III restriction enzyme, res subunit  30.47 
 
 		 877 aa  205  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0566  Type III site-specific deoxyribonuclease  29.9 
 
 		 891 aa  205  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0796023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0579  Type III site-specific deoxyribonuclease  30.82 
 
 		 891 aa  201  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.193547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1742  type III restriction system endonuclease  25.78 
 
 		 990 aa  196  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0236  type III restriction enzyme, res subunit  26.06 
 
 		 991 aa  193  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2180  Type III site-specific deoxyribonuclease  26.21 
 
 		 984 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1547  type III restriction system endonuclease  26.33 
 
 		 989 aa  191  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1114  type III restriction-modification system, restriction endonuclease subunit  30.25 
 
 		 1019 aa  191  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1522  type III restriction protein res subunit  30.62 
 
 		 1008 aa  190  9e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000221168  hitchhiker  0.00161886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2486  type III restriction enzyme, res subunit  25.38 
 
 		 1010 aa  189  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252383  decreased coverage  0.0052761 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1149  type III restriction protein res subunit  29.58 
 
 		 1024 aa  188  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.511254  normal  0.0779427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4592  Type III site-specific deoxyribonuclease  29.51 
 
 		 997 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2927  Type III restriction enzyme, res subunit  30.24 
 
 		 1010 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00341327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4204  type III restriction protein res subunit  30.85 
 
 		 1001 aa  185  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416822  normal  0.0251436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5226  type III restriction protein res subunit  31.03 
 
 		 1018 aa  184  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.310365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0365  type III restriction protein res subunit  25.79 
 
 		 978 aa  183  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000898416 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1393  type III restriction protein res subunit  26.14 
 
 		 993 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0226  type III restriction protein res subunit  29.14 
 
 		 887 aa  181  4e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000256753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2246  type III restriction enzyme, res subunit  28.14 
 
 		 1033 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.428313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0790  type III restriction enzyme, res subunit  25.31 
 
 		 992 aa  181  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186387 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0162  type III restriction enzyme, res subunit  29.57 
 
 		 998 aa  180  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000922186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2729  restriction endonuclease  29.98 
 
 		 909 aa  177  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1130  type III restriction system endonuclease  26.86 
 
 		 991 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05380  restriction endonuclease  31.63 
 
 		 1001 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224122  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1948  type III restriction protein res subunit  29.55 
 
 		 982 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0362  type III restriction-modification system, res subunit  24.64 
 
 		 1054 aa  175  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.262363  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0929  type III restriction protein res subunit  27.89 
 
 		 1060 aa  175  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0544  type III restriction enzyme, res subunit  29.25 
 
 		 1012 aa  175  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3485  type III restriction enzyme, res subunit  28.07 
 
 		 1019 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340393  normal  0.439729 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0155  type III restriction protein res subunit  25.49 
 
 		 1009 aa  172  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156015  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1200  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1076 aa  169  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.563874  normal  0.0639023 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3281  type III restriction-modification system, res subunit  25.03 
 
 		 1009 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1846  type III restriction-modification system, res subunit  25.03 
 
 		 1009 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2706  Type III restriction enzyme, res subunit  25.03 
 
 		 1009 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2673  type III restriction-modification system, res subunit  25.03 
 
 		 1009 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  25.03 
 
 		 1009 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0042  type III restriction-modification system, res subunit  28.42 
 
 		 1009 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  29.18 
 
 		 1009 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1827  type III restriction enzyme, res subunit  31.06 
 
 		 1032 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0260  type III restriction system endonuclease  29.18 
 
 		 1009 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0028  type III restriction protein res subunit  29.11 
 
 		 1008 aa  165  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0019  type III restriction enzyme, res subunit  29.11 
 
 		 1011 aa  163  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0028  type III restriction protein res subunit  28.94 
 
 		 1004 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0046  type III restriction protein res subunit  28.94 
 
 		 1008 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0027  type III restriction enzyme, res subunit  28.94 
 
 		 1008 aa  162  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0043  type III restriction enzyme, res subunit  28.94 
 
 		 1008 aa  162  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.855331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3046  Type III site-specific deoxyribonuclease  28.31 
 
 		 994 aa  160  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3212  Type III restriction enzyme, res subunit  28.97 
 
 		 1008 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0849  Type III site-specific deoxyribonuclease  29.31 
 
 		 998 aa  157  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  45.57 
 
 		 930 aa  51.2  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  32.58 
 
 		 893 aa  50.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  58.33 
 
 		 894 aa  48.5  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  37.35 
 
 		 911 aa  48.5  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3655  Type III restriction-modification enzyme helicase subunit  37.5 
 
 		 911 aa  48.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000324142  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0026  type III restriction-modification system, R subunit, putative  37.5 
 
 		 882 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.352538  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  37.5 
 
 		 923 aa  47.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  45.83 
 
 		 896 aa  45.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>