More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1224 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1224  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  100 
 
 		 384 aa  787    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  56.32 
 
 		 382 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0534  pyridoxal-phosphate dependent aminotransferase  52.76 
 
 		 381 aa  410  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1373  cysteine desulphurase  52.8 
 
 		 381 aa  391  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00618105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0450  aminotransferase (class V), putative  51.07 
 
 		 381 aa  386  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0570589  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  48.29 
 
 		 380 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  45.9 
 
 		 380 aa  335  7e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  46.34 
 
 		 381 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  46.17 
 
 		 380 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  45.36 
 
 		 380 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  45.36 
 
 		 380 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  45.36 
 
 		 380 aa  323  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  45.36 
 
 		 380 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  45.36 
 
 		 380 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  45.36 
 
 		 380 aa  322  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  45.36 
 
 		 380 aa  322  6e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  45.08 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  45.08 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  44.86 
 
 		 383 aa  305  7e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  41.8 
 
 		 382 aa  300  4e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  41.98 
 
 		 377 aa  293  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  42.08 
 
 		 381 aa  290  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  43.19 
 
 		 381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  43.44 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  42.41 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  42.97 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  40.36 
 
 		 398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  44.53 
 
 		 383 aa  286  4e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40.92 
 
 		 382 aa  285  9e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  42.63 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  43.19 
 
 		 384 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  40.99 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  40.47 
 
 		 394 aa  280  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  41.55 
 
 		 384 aa  279  7e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  41.04 
 
 		 395 aa  276  6e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  40.21 
 
 		 388 aa  275  8e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  38.87 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  38.78 
 
 		 398 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  39.59 
 
 		 409 aa  272  9e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  40.05 
 
 		 382 aa  272  9e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  38.46 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  39.79 
 
 		 404 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  40.73 
 
 		 402 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  39.14 
 
 		 388 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  39.58 
 
 		 396 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  41.02 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  39.15 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.07 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  37.6 
 
 		 403 aa  266  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  39.16 
 
 		 414 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  38.78 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  37.5 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.15 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  40.99 
 
 		 393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  41.16 
 
 		 380 aa  259  6e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  41.16 
 
 		 380 aa  259  6e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  41.55 
 
 		 398 aa  259  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  39.84 
 
 		 387 aa  259  6e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  39.26 
 
 		 398 aa  258  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  39.23 
 
 		 398 aa  258  8e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  39.23 
 
 		 398 aa  258  8e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  37.5 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.41 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  38.11 
 
 		 388 aa  255  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  38.52 
 
 		 396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  38.16 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  38.96 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  39.12 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.02 
 
 		 388 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1807  aminotransferase class V  39.46 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.113842  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1772  aminotransferase, class V  39.46 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.44 
 
 		 400 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1099  aminotransferase class V  38.44 
 
 		 378 aa  248  9e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.386639  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  38.02 
 
 		 402 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  39.52 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  36.18 
 
 		 393 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  38.68 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  38.71 
 
 		 399 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  39.63 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  36.22 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  38.58 
 
 		 380 aa  243  6e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  37.14 
 
 		 394 aa  242  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  38.62 
 
 		 381 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  38.12 
 
 		 394 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  39.09 
 
 		 417 aa  242  9e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  39.11 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  37.5 
 
 		 384 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1261  Cysteine desulfurase  39.19 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0457777  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1280  aminotransferase, class V  37.7 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0012721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  37.92 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  39.78 
 
 		 381 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  37.66 
 
 		 391 aa  239  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  36.81 
 
 		 404 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  39.3 
 
 		 381 aa  239  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  39.02 
 
 		 381 aa  238  9e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  39.51 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  37.98 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  39.84 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  39.3 
 
 		 381 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  39.02 
 
 		 381 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>