More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1119 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
175 aa  359  1e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  41.77 
 
 
155 aa  114  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  38.99 
 
 
156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  39.24 
 
 
155 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  39.24 
 
 
155 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  41.88 
 
 
153 aa  106  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  43.51 
 
 
160 aa  104  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  39.24 
 
 
156 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  37.74 
 
 
156 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  39.44 
 
 
161 aa  101  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  37.74 
 
 
156 aa  101  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  36.48 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  36.48 
 
 
156 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  39.01 
 
 
165 aa  99.4  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  36.48 
 
 
156 aa  98.6  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  36.48 
 
 
156 aa  98.6  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  36.48 
 
 
156 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  36.48 
 
 
156 aa  98.6  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  36.48 
 
 
156 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  36.48 
 
 
156 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  37.11 
 
 
156 aa  97.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  35.57 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  36.2 
 
 
157 aa  95.9  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  36.55 
 
 
159 aa  94.7  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  34.48 
 
 
201 aa  91.3  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  35.42 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  37.04 
 
 
157 aa  87.8  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  37.3 
 
 
446 aa  87.8  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  41.8 
 
 
169 aa  87.4  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  35.29 
 
 
154 aa  87  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  36.13 
 
 
154 aa  87  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  30.46 
 
 
168 aa  87  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  33.53 
 
 
155 aa  86.7  2e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  36.67 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1642  protein of unknown function UPF0054  45.76 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0208313  hitchhiker  0.00194767 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  29.75 
 
 
161 aa  84.3  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  34.33 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  29.75 
 
 
159 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  34.45 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  32.84 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.3 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  30.97 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  30.43 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  29.11 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  32.79 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  37.82 
 
 
154 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  34.71 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  30.58 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  30.58 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  35.38 
 
 
301 aa  80.9  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  33.06 
 
 
157 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  36 
 
 
152 aa  80.5  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  30.17 
 
 
159 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  34.17 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  33.77 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  33.85 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  32.81 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  33.09 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  29.38 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  32.84 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  28.93 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  30 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  28.93 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  28.93 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  28.93 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  30.08 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  34.19 
 
 
274 aa  77.4  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  33.61 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  31.34 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  32.31 
 
 
157 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  33.9 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  31.06 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  31.62 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  37.01 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  33.88 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  33.05 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  33.08 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  31.54 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  38.46 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  39.62 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  33.9 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  35.76 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  30.83 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  33.61 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  31.67 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  28.67 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  28.57 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  34.13 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  31.16 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0994  putative metalloprotease  31.47 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0176097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  31.93 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  33.08 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  38.84 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  35.61 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  26.54 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  32.61 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  32.79 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  33.07 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>