265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1740 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  100 
 
 		 379 aa  775    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  61.66 
 
 		 375 aa  481  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  58.33 
 
 		 372 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  55.41 
 
 		 401 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  56.99 
 
 		 372 aa  436  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  51.47 
 
 		 368 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  51.74 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  51.74 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  51.74 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  51.74 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  51.74 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  51.74 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  51.74 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  51.47 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  51.47 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  51.88 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  50.67 
 
 		 368 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  51.63 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  50.4 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  46.51 
 
 		 366 aa  342  4e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  44.27 
 
 		 385 aa  332  7.000000000000001e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  45.92 
 
 		 366 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  45.92 
 
 		 366 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  37.57 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  32.88 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  32.08 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  32.38 
 
 		 710 aa  191  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  30.26 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.38 
 
 		 379 aa  178  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  30.85 
 
 		 365 aa  169  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  29.63 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  28.84 
 
 		 376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  27.69 
 
 		 357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  29.79 
 
 		 604 aa  143  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.64 
 
 		 391 aa  142  7e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  27.1 
 
 		 361 aa  136  5e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  29.69 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  31.47 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1662  GTP-binding protein EngA  30.32 
 
 		 465 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  30 
 
 		 291 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  28.74 
 
 		 443 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  28.72 
 
 		 463 aa  53.9  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  29.41 
 
 		 299 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  32 
 
 		 438 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  28.12 
 
 		 360 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  26.89 
 
 		 597 aa  53.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  28.82 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0591  GTP-binding protein EngA  29.66 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  30.57 
 
 		 260 aa  52.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  25 
 
 		 560 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  31.91 
 
 		 287 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  28.24 
 
 		 280 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  44.59 
 
 		 511 aa  50.8  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  27.54 
 
 		 562 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0680  tRNA modification GTPase TrmE  36.84 
 
 		 438 aa  50.4  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000180906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06108  GTP-binding protein EngA  31.54 
 
 		 465 aa  50.4  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0692336  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01058  GTP-binding protein EngA  31.54 
 
 		 465 aa  50.4  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  29.67 
 
 		 277 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2840  small GTP-binding protein  30.6 
 
 		 501 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118235 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  27.23 
 
 		 544 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  25.6 
 
 		 534 aa  49.7  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  28.74 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  47.14 
 
 		 464 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  23.63 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.57 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  29.08 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  29.76 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  27.72 
 
 		 436 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  24.75 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14830  GTP-binding protein EngA  34 
 
 		 470 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  27.54 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  28.48 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  42.5 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  42.5 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  29.37 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  42.5 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  29.37 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  22.33 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  41.98 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  26.98 
 
 		 473 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  42.5 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  42.5 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  42.5 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  42.5 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  42.5 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  30 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  28.32 
 
 		 262 aa  47.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  28.7 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  28.32 
 
 		 262 aa  47.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  30 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  26.22 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  28.4 
 
 		 494 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.05 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  31.79 
 
 		 438 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  26.88 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1252  GTP-binding protein EngA  37.5 
 
 		 490 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  25.82 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  28.74 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0857  GTP-binding protein EngA  40.28 
 
 		 487 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  35.35 
 
 		 498 aa  47  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>