More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1219 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1219  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  100 
 
 
271 aa  552  1e-156  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0532585  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1060  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  77.24 
 
 
276 aa  437  9.999999999999999e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.457303  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1062  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  62.59 
 
 
291 aa  340  1e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000072755  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.11 
 
 
281 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  35.89 
 
 
304 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  34.69 
 
 
403 aa  136  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  32.3 
 
 
309 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  34.29 
 
 
439 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  35.84 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  33.08 
 
 
327 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  33.33 
 
 
394 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  32.02 
 
 
369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  32.42 
 
 
360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1932  band 7 protein  32.42 
 
 
315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  32.95 
 
 
398 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.47 
 
 
328 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  32.38 
 
 
416 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  31.75 
 
 
369 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  31.2 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  32.17 
 
 
406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.94 
 
 
376 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  32.31 
 
 
319 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  31.99 
 
 
429 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  32.35 
 
 
305 aa  125  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12020  SPFH domain, Band 7 family protein  32.16 
 
 
396 aa  125  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0191878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  32.35 
 
 
305 aa  125  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.57 
 
 
318 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  33.92 
 
 
456 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  33.48 
 
 
402 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.63 
 
 
304 aa  122  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.92 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.63 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  32.68 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2939  band 7 protein  34.3 
 
 
312 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0124635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  29.43 
 
 
305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  31.28 
 
 
345 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  33.01 
 
 
473 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  31.35 
 
 
359 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.62 
 
 
286 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  33.02 
 
 
306 aa  118  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  32.06 
 
 
303 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  30.71 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  30.71 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.08 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.73 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2414  band 7 protein  34.8 
 
 
446 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  31.48 
 
 
303 aa  116  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  30.77 
 
 
319 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  29.96 
 
 
356 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  29.89 
 
 
321 aa  115  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  32.38 
 
 
315 aa  115  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  29.69 
 
 
336 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  34.47 
 
 
304 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.47 
 
 
304 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  31.68 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.93 
 
 
310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  32.39 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  31.68 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1091  band 7 protein  30.83 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.84 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  30.04 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  25.86 
 
 
322 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  28.62 
 
 
314 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.33 
 
 
309 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  32.13 
 
 
312 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  32.13 
 
 
312 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  29.57 
 
 
361 aa  112  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  32.85 
 
 
309 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  29.39 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  33.18 
 
 
311 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  32.3 
 
 
361 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  28.52 
 
 
311 aa  112  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  32.85 
 
 
308 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.55 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  29.55 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  29.55 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.55 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  29.55 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  33.17 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  29.55 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1623  band 7 protein  31.68 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.96 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  29.55 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3137  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.9 
 
 
392 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  31.38 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37859  predicted protein  30 
 
 
348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370877  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  27.86 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  29.82 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  31.38 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  36.05 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0139  band 7 protein  34.38 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.889576  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3126  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.9 
 
 
392 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  31.38 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  31.38 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  36.1 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3187  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.9 
 
 
392 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  31.1 
 
 
304 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  30.93 
 
 
326 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.68 
 
 
268 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  32.52 
 
 
308 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>