More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1062 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1062  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  100 
 
 		 291 aa  588  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000072755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1219  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  62.59 
 
 		 271 aa  340  1e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0532585  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1060  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  58.58 
 
 		 276 aa  329  3e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.457303  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  33.6 
 
 		 309 aa  155  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  35.53 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  35.53 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  35.53 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  30.91 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  37.93 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.1 
 
 		 328 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  32.89 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  30.07 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.68 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1091  band 7 protein  37.95 
 
 		 282 aa  132  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.68 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  33.21 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.21 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.89 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  28.89 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  28.89 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.89 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.21 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  28.89 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  28.89 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  31.14 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.36 
 
 		 359 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  29.73 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  31.14 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  28.03 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.4 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  28.57 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  29.11 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  27.56 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5341  band 7 protein  32.17 
 
 		 307 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207546  normal  0.117184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  32.61 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.44 
 
 		 281 aa  126  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  31.72 
 
 		 310 aa  125  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  31.02 
 
 		 345 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  29.43 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  31.65 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  32.75 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  29.23 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  29.23 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.23 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  29.23 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  30.11 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  33.95 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  29.23 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.23 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  29.23 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.95 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  29.23 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.93 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  30.71 
 
 		 429 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  33.75 
 
 		 403 aa  123  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  29.67 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.9 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  30.72 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.67 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1932  band 7 protein  31.68 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.87 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.82 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  30 
 
 		 317 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  30.79 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  30 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  27.69 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  28.95 
 
 		 305 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  28.95 
 
 		 305 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  28.95 
 
 		 305 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  28.95 
 
 		 305 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  31.47 
 
 		 406 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  27.57 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.66 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  30.34 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  30.34 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  30.34 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11517  hypothetical protein  32.74 
 
 		 381 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.49 
 
 		 376 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  29.69 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.41 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  28.37 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  30.69 
 
 		 398 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  27.66 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  27.66 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.01 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  29.41 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  29.03 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  25.77 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  34.95 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2939  band 7 protein  30.77 
 
 		 312 aa  118  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0124635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.57 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.57 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  29.07 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  30.69 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>