42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2472 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  347  6e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  72.67 
 
 		 167 aa  254  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  72.5 
 
 		 173 aa  244  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  56.96 
 
 		 163 aa  175  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  53.8 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  43.59 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  33.12 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  30.49 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  31.03 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  34.75 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  26 
 
 		 271 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  29.46 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0599  hypothetical protein  30.23 
 
 		 113 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000657339  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  31.4 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  29.67 
 
 		 110 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1266  protein of unknown function UPF0153  28.57 
 
 		 246 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  28.35 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  34.88 
 
 		 142 aa  48.5  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  30.51 
 
 		 273 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  28.81 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  32.22 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  27.88 
 
 		 112 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  34.26 
 
 		 258 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0986  hypothetical protein  30.43 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  32.65 
 
 		 303 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  29.29 
 
 		 276 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  27.96 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  29.63 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  25.71 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  32.95 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  32.95 
 
 		 240 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  31.43 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  29.63 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  26.45 
 
 		 281 aa  42.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  29.63 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  30.84 
 
 		 124 aa  42.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  29.67 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  32.04 
 
 		 124 aa  41.6  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  26.17 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  27.08 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  25.71 
 
 		 140 aa  40.8  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>