52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2190 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  42.94 
 
 		 186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  42.94 
 
 		 188 aa  150  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  38.07 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  37.22 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 178 aa  84.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  25.61 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  26.51 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  31.36 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  31.36 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  26.71 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  27.52 
 
 		 548 aa  61.6  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  25.86 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  26.4 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  29.01 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  27.33 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  27.95 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  30.58 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  23.94 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  21.84 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  27.89 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  25.6 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  25.6 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  25.6 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 139 aa  48.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  19.77 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 139 aa  45.4  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  28.39 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  30.21 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  25.37 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 		 283 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34 
 
 		 346 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34 
 
 		 346 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34 
 
 		 346 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.3 
 
 		 346 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34 
 
 		 346 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  27.83 
 
 		 146 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>