More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21570 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_21570  amino acid transporter  100 
 
 		 503 aa  988    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.393168  hitchhiker  0.00168939 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0232  amino acid permease family protein  44.72 
 
 		 496 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0607  amino acid permease-associated region  44.24 
 
 		 494 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0621  amino acid permease-associated region  44.24 
 
 		 494 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0221  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 		 490 aa  349  7e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0974  amino acid permease-associated region  40.45 
 
 		 502 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0717  amino acid permease family protein  32.96 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0730  amino acid permease family protein  33.26 
 
 		 436 aa  274  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0152  amino acid permease family protein  30.38 
 
 		 451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.237797  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  33.06 
 
 		 480 aa  205  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  32.79 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  29.9 
 
 		 486 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  30.88 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  33.84 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20300  amino acid transporter  33.41 
 
 		 471 aa  181  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.533363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0244  amino acid permease-associated region  32.86 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.912876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1276  amino acid permease-associated region  29.19 
 
 		 480 aa  136  8e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22930  amino acid transporter  29.78 
 
 		 494 aa  106  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0974202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3189  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 494 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.35 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  30.21 
 
 		 518 aa  87.8  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  26.1 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  25.9 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.04 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.04 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.04 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  25.7 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.2 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  25.3 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  24.27 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  25.3 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  24.65 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  25.84 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  24.07 
 
 		 471 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  26.53 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.07 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.07 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.07 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  22.87 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  23.27 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  26.53 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  24.07 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  26.13 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.07 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  26.53 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  26.53 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  23.2 
 
 		 513 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  24.53 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 475 aa  78.2  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2786  amino acid permease family protein  22.87 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000595058  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  25.87 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 471 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  23.36 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  23.57 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  23.96 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  25.87 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  24.79 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  23.37 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  23.36 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  23.37 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  25.2 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 473 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  23.05 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  28.61 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  23.47 
 
 		 487 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  26.29 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  24.8 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  25.9 
 
 		 525 aa  74.3  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  26.29 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  23.92 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  23.81 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  28.07 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2998  amino acid permease family protein  23.05 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000337351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  27.1 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  26.1 
 
 		 473 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  26.33 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  26.32 
 
 		 473 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>