293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4280 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 170 aa  341  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  54.66 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  54.17 
 
 		 159 aa  157  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  53.74 
 
 		 159 aa  157  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  54.55 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  53.42 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  53.42 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  51.27 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  50.67 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  50.98 
 
 		 167 aa  143  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  53.69 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  49.32 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  41.13 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  43.51 
 
 		 158 aa  97.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  44.27 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  40.44 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  45.52 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  40.91 
 
 		 159 aa  93.2  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  40.5 
 
 		 155 aa  90.5  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  37.59 
 
 		 155 aa  87.8  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  39.83 
 
 		 162 aa  85.1  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  36.55 
 
 		 155 aa  84  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  34.97 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  34.09 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  34.09 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  34.09 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  35.25 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1283  Ferritin and Dps  32.17 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2872  Ferritin and Dps  32.43 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.146196  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3834  Ferritin and Dps  32.17 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6797  putative DNA-binding stress protein (oxydative damage protectant)  28.57 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  38.33 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4342  Ferritin Dps family protein  31.29 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643085  normal  0.793177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4661  Ferritin Dps family protein  31.29 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2447  ferritin and Dps  28.86 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.429577  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  33.08 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4674  Ferritin Dps family protein  30.61 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1468  Ferritin Dps family protein  30.07 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  35.2 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0195  Ferritin and Dps  29.58 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.97 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4607  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2003  Ferritin Dps family protein  31.41 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.97873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1521  Ferritin Dps family protein  31.06 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530071  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0140  Ferritin Dps family protein  28.57 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.572048 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1191  Ferritin Dps family protein  29.61 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.400425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  32.45 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.1 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0957  Ferritin and Dps  29.22 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.104703 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  28.48 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  31.47 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1535  Ferritin Dps family protein  30.3 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146726  normal  0.305527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  31.01 
 
 		 137 aa  62  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  32.26 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5237  Ferritin Dps family protein  27.97 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4770  Ferritin Dps family protein  27.97 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4325  Ferritin Dps family protein  25.9 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  28.57 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  32.87 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4157  Ferritin Dps family protein  27.14 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  27.74 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  27.86 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  33.33 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5312  Ferritin Dps family protein  27.08 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158594  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  27.56 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  33.57 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.09 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  30.83 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  27.61 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  32.28 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.16 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2171  starvation induced DNA binding protein  26.22 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.77873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2099  Ferritin Dps family protein  26.35 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  25.93 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.14 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  30.99 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  27.01 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  29.55 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  32.17 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.12 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  31.69 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  32.85 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.1 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  29.71 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2338  Ferritin Dps family protein  27.74 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.301965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  32.61 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0536  Ferritin Dps family protein  40 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  25 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.14 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2946  Ferritin Dps family protein  29.2 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  29.08 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  32.12 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  29.08 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  29.08 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  32.12 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>