More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2077 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  100 
 
 		 473 aa  917    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  58.68 
 
 		 446 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  61.5 
 
 		 476 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  54.92 
 
 		 455 aa  491  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  56.49 
 
 		 447 aa  488  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  54.69 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  56.06 
 
 		 447 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  58.65 
 
 		 450 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  58.86 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  58.41 
 
 		 435 aa  465  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  56.24 
 
 		 503 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  58.58 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  57.51 
 
 		 442 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  56.25 
 
 		 449 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  51.13 
 
 		 468 aa  398  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  52.88 
 
 		 480 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  57.25 
 
 		 569 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  53.78 
 
 		 453 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  42.26 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  44.67 
 
 		 473 aa  350  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  41.3 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  39.02 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  38.14 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  38.14 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  38.14 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  38.14 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  39.02 
 
 		 453 aa  306  7e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  38.8 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  38.8 
 
 		 453 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  38.8 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  38.8 
 
 		 453 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  38.58 
 
 		 453 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  42.65 
 
 		 481 aa  282  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  38.94 
 
 		 448 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  37.39 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  35.14 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  38.99 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  38.8 
 
 		 449 aa  267  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.04 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  38.79 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.98 
 
 		 494 aa  216  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  31.84 
 
 		 452 aa  210  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  36.18 
 
 		 570 aa  207  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.41 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  31.71 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  39.42 
 
 		 579 aa  190  5e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  32.18 
 
 		 429 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  32.18 
 
 		 436 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  36.9 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  32.41 
 
 		 445 aa  173  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  30.57 
 
 		 453 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  31.71 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  32.49 
 
 		 445 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  30.75 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  30.48 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  32.49 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  31.5 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  31.5 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  32.78 
 
 		 443 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  32.78 
 
 		 443 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  30.47 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  30.09 
 
 		 440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  31.28 
 
 		 456 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4066  dihydropyrimidinase  32.56 
 
 		 479 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  35.8 
 
 		 454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  34.94 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  32.6 
 
 		 446 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  33.1 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  31.36 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  28.24 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  31.21 
 
 		 446 aa  160  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  30.93 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.28 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  30.65 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  32.13 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  29.52 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  32.05 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.89 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  31.21 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.11 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.19 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.29 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  34.79 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  28.07 
 
 		 425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  31.83 
 
 		 458 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  29.66 
 
 		 428 aa  157  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.39 
 
 		 429 aa  156  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  32.01 
 
 		 437 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  31.04 
 
 		 445 aa  156  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  29.48 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  31.54 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  31.54 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  31.75 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  32.44 
 
 		 428 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  35.46 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  31.03 
 
 		 445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1707  dihydroorotase  33.49 
 
 		 451 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  29.66 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.3 
 
 		 432 aa  154  5e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  37.47 
 
 		 467 aa  153  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>