More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2066 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  100 
 
 		 165 aa  333  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  72.79 
 
 		 154 aa  227  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  72.79 
 
 		 154 aa  227  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  72.79 
 
 		 154 aa  227  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  71.23 
 
 		 146 aa  221  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  69.5 
 
 		 164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  65.07 
 
 		 151 aa  197  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.14 
 
 		 150 aa  191  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  67.81 
 
 		 158 aa  191  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.26 
 
 		 274 aa  149  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  49.3 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  48.23 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.48 
 
 		 143 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  45.07 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.65 
 
 		 145 aa  145  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.32 
 
 		 143 aa  144  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.43 
 
 		 139 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.43 
 
 		 139 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  53.57 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  50.35 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  46.15 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  48.25 
 
 		 149 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  50.67 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  45.52 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.66 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.52 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.3 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  46.53 
 
 		 145 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  46.53 
 
 		 145 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  42.36 
 
 		 145 aa  137  8.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  46.53 
 
 		 145 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.67 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.83 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  52.48 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  42.36 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  48.59 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  45.83 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  50.35 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.31 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  44.06 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  43.75 
 
 		 145 aa  134  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  44.06 
 
 		 145 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  43.75 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  43.75 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.75 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.07 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  43.75 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  50.38 
 
 		 176 aa  130  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.73 
 
 		 146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  42.66 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  49.31 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  42.47 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  46.1 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  38.26 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.51 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  33.09 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  33.82 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.35 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1609  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.12 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0448042  normal  0.295189 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  34.46 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.39 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.68 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.41 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  33.8 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  31.76 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  35 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  29.86 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  30.99 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  34.23 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1208  tRNA-adenosine deaminase  31.45 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.755847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.95 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.22 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.87 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.41 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.41 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.96 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  28.17 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  37.08 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.41 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  28.17 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  34.03 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  32.35 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.71 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  34.71 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  33.33 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.34 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  32.29 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.58 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.74 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.92 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.74 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  31.47 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  30.61 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.55 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  31.25 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  33.59 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.82 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>