93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2433 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 335 aa  684    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  56.1 
 
 		 339 aa  340  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  49.2 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  48.57 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  48.21 
 
 		 321 aa  275  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  48.41 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  47.83 
 
 		 331 aa  263  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  45.89 
 
 		 337 aa  262  4.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  48.46 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  47.47 
 
 		 330 aa  245  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  46.75 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  41.53 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  42.41 
 
 		 369 aa  230  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  42.45 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  42.72 
 
 		 353 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  40.88 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  40.36 
 
 		 341 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  41.12 
 
 		 398 aa  212  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  42.5 
 
 		 340 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  42.5 
 
 		 340 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  42.5 
 
 		 340 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  40.18 
 
 		 354 aa  206  6e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  41.14 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  40.67 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  39.46 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  40.62 
 
 		 353 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  40.94 
 
 		 346 aa  189  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 		 332 aa  189  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  40.71 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  37.3 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  39.25 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  33.98 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  33.91 
 
 		 361 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  41.82 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  37.35 
 
 		 369 aa  172  5.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  34.33 
 
 		 336 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  32.74 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  37.58 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  38.29 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  30.07 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  31.47 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 289 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  23.05 
 
 		 338 aa  49.7  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  27.27 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1082  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 287 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2897  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 344 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  29.94 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  28.97 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  28.97 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  36.44 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  26.05 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  28.97 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 559 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  31.82 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12291  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  25 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230959  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  24.65 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  24.4 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  28.28 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  28.28 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  35.63 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  25.85 
 
 		 277 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  28.47 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  28.47 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 284 aa  43.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 275 aa  42.7  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  22.46 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 290 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  33.33 
 
 		 279 aa  42.4  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1033  hypothetical protein  29.57 
 
 		 336 aa  42.7  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0782021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>