184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0481 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  100 
 
 		 782 aa  1498    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  30.68 
 
 		 882 aa  286  9e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.75 
 
 		 769 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 825 aa  254  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  25.55 
 
 		 869 aa  245  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  25.32 
 
 		 869 aa  244  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  25.43 
 
 		 869 aa  244  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  25.32 
 
 		 869 aa  244  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.75 
 
 		 797 aa  242  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  25.63 
 
 		 911 aa  241  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  34.85 
 
 		 732 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  31.04 
 
 		 819 aa  216  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.97 
 
 		 946 aa  214  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  23.14 
 
 		 923 aa  211  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  24.89 
 
 		 915 aa  210  8e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  23.25 
 
 		 924 aa  208  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.94 
 
 		 711 aa  205  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.25 
 
 		 857 aa  203  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.86 
 
 		 737 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  28.76 
 
 		 759 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  25.89 
 
 		 772 aa  191  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  32.02 
 
 		 740 aa  188  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  25.61 
 
 		 772 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  26.74 
 
 		 1111 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.26 
 
 		 692 aa  172  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  27.02 
 
 		 1114 aa  170  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.89 
 
 		 785 aa  167  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  29.28 
 
 		 733 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  22.09 
 
 		 666 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  27.71 
 
 		 695 aa  165  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.61 
 
 		 702 aa  164  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  27.23 
 
 		 663 aa  160  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  25.28 
 
 		 789 aa  160  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  27.87 
 
 		 666 aa  160  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  27.33 
 
 		 666 aa  159  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  27.75 
 
 		 666 aa  158  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  28.48 
 
 		 683 aa  154  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  27.37 
 
 		 666 aa  153  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 669 aa  153  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  26.38 
 
 		 666 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  26.38 
 
 		 666 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  27.59 
 
 		 666 aa  152  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  30.2 
 
 		 1037 aa  151  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 669 aa  151  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  27.47 
 
 		 721 aa  150  9e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  26.8 
 
 		 823 aa  148  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.32 
 
 		 666 aa  147  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  31.81 
 
 		 988 aa  147  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  26.31 
 
 		 623 aa  143  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  28.02 
 
 		 955 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  29.66 
 
 		 728 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.03 
 
 		 678 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1246 aa  120  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  24.02 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  27.33 
 
 		 649 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0820  hypothetical protein  25.35 
 
 		 863 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 		 678 aa  116  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  24.17 
 
 		 779 aa  110  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.25 
 
 		 646 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  25.12 
 
 		 597 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0549  hypothetical protein  28.63 
 
 		 767 aa  103  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  24.25 
 
 		 754 aa  102  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27 
 
 		 631 aa  101  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  26.82 
 
 		 1040 aa  97.8  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  20.99 
 
 		 723 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  26.16 
 
 		 1038 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1041 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  25 
 
 		 1038 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  32.24 
 
 		 1068 aa  95.1  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  26.38 
 
 		 1038 aa  94.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  26.98 
 
 		 1041 aa  92  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  25.62 
 
 		 1038 aa  92  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  25.96 
 
 		 888 aa  90.9  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.06 
 
 		 728 aa  89.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2741  hypothetical protein  25.19 
 
 		 810 aa  88.2  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2524  hypothetical protein  32.29 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  23.08 
 
 		 1038 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1002 aa  83.2  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  23.81 
 
 		 1049 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  20.03 
 
 		 721 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  24.65 
 
 		 876 aa  81.6  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  20.79 
 
 		 721 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  25.88 
 
 		 1068 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  25.58 
 
 		 720 aa  80.1  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  23.21 
 
 		 717 aa  79.7  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  28.7 
 
 		 1054 aa  79  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  25.38 
 
 		 1186 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  23.77 
 
 		 724 aa  78.2  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  27.18 
 
 		 1012 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  20.12 
 
 		 1026 aa  75.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1908  membrane protein-like protein  25.72 
 
 		 642 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  21.07 
 
 		 718 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.66 
 
 		 1211 aa  75.9  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03260  predicted membrane protein  30.95 
 
 		 961 aa  74.3  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.484426 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  25.11 
 
 		 1232 aa  74.3  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  23.63 
 
 		 887 aa  74.3  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  23.48 
 
 		 958 aa  72.8  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  25.52 
 
 		 962 aa  72  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0273  membrane protein-like protein  35.68 
 
 		 982 aa  69.7  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  29.49 
 
 		 737 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>