More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1239 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1239  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677106 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2302  AsnC family transcriptional regulator  63.58 
 
 		 151 aa  196  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0652  AsnC family transcriptional regulator  62.91 
 
 		 151 aa  193  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.22955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1866  AsnC family transcriptional regulator  62.91 
 
 		 151 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0515  AsnC family transcriptional regulator  62.25 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.900323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2395  transcriptional regulator  64.67 
 
 		 152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1759  AsnC family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0120773  normal  0.159255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1867  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0516  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.904906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  30.67 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.67 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 162 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  36.3 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3223  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3042  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3081  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 		 151 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0598  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5396  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 		 175 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1611  normal  0.0284366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1694  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.849273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2001  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 158 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0653  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1620  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.120011  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0580  AsnC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_004310  BR1676  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0583665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.8 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  29.8 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  32.67 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  29.14 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1758  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00375085  normal  0.163096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  29.14 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  29.14 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.892509 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5406  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  29.33 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  29.14 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1240  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  29.14 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  29.14 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  29.14 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2301  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>