134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0559 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  100 
 
 		 63 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  65.08 
 
 		 66 aa  89.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  53.97 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  58.33 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1705  preprotein translocase subunit SecE  55 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.431782  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0333  preprotein translocase subunit SecE  55 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.06103  normal  0.779327 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0347  preprotein translocase subunit SecE  55 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423362  normal  0.683866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  47.37 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3862  preprotein translocase, SecE subunit  50.85 
 
 		 63 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0603678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  53.45 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  50.88 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0226  preprotein translocase subunit SecE  60.66 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  52.63 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  45.16 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1341  preprotein translocase, SecE subunit  53.85 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0600697  normal  0.152691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  50.88 
 
 		 62 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  46.27 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  47.46 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  49.12 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  49.12 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  50.88 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  50.88 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  52 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4365  preprotein translocase, SecE subunit  49.12 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3996  preprotein translocase, SecE subunit  49.12 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  47.37 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  45.76 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1808  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.38 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.480842  normal  0.242423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4443  preprotein translocase, SecE subunit  43.86 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5089  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  52.08 
 
 		 52 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746312  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1825  preprotein translocase subunit SecE  56.9 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0959491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  41.07 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1416  preprotein translocase subunit SecE  48.33 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.970626  normal  0.402516 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1318  preprotein translocase subunit SecE  48.33 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0854776  normal  0.244779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1941  preprotein translocase subunit SecE  51.72 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437033  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1320  preprotein translocase, SecE subunit  44.9 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1250  preprotein translocase subunit SecE  51.72 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1211  preprotein translocase subunit SecE  51.72 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0972  preprotein translocase subunit SecE  51.72 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836456 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  33.9 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1445  SecE subunit of protein translocation complex  41.86 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  52.17 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002167  preprotein translocase subunit SecE  40.43 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00231  preprotein translocase subunit SecE  40.43 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  48.89 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  39.13 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  38.89 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  46.67 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  41.3 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  47.62 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  46 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2724  preprotein translocase subunit SecE  45.24 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108515  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  36.96 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  41.86 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1493  preprotein translocase, SecE subunit  31.67 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.394674  normal  0.332847 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0282  SecE subunit of protein translocation complex  35.59 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 		 60 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3040  preprotein translocase subunit SecE  42.55 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3351  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0381  preprotein translocase subunit SecE  43.18 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0356  preprotein translocase subunit SecE  43.18 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3433  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2773  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101762  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0253  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0223726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0334  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000349091  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  36.96 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00689  Preprotein translocase subunit SecE  44.68 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000478021  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0235  preprotein translocase subunit SecE  45.45 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  0.0123007 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0313  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000158246  normal  0.139 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0262  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000233394  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  41.82 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  37.29 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3598  preprotein translocase subunit SecE  46.3 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3340  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.96 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2258  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  41.82 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2973  preprotein translocase subunit SecE  42.55 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  27.59 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  35.19 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  27.59 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3320  preprotein translocase subunit SecE  42.55 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3195  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 126 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0644038  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 		 63 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 78 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 78 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0306  preprotein translocase subunit SecE  43.64 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970626  normal  0.0458537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  40.43 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4537  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0688027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>