69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3067 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3067  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 129 aa  256  8e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2513  nitrogen-fixing NifU domain protein  90.27 
 
 		 131 aa  210  5.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.455393  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0039  NifU domain-containing protein  48.08 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.781326  normal  0.020346 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0148  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.21 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1999  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.59 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3685  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.48 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0901  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.21 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0908  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.71 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3369  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.17 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3750  putative DNA uptake protein  45.33 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0163  putative DNA uptake protein  45.33 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3990  putative DNA uptake protein  45.33 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  42.03 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  42.03 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  42.03 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  42.03 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  42.03 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  42.03 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  42.03 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  42.03 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  42.03 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4119  putative DNA uptake protein  42.67 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0234  putative DNA uptake protein  43.48 
 
 		 191 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0316  putative DNA uptake protein  43.48 
 
 		 191 aa  50.4  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3926  putative DNA uptake protein  42.67 
 
 		 191 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4634  putative DNA uptake protein  42.67 
 
 		 191 aa  50.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0159  putative DNA uptake protein  41.86 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3819  putative DNA uptake protein  42.03 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3785  putative DNA uptake protein  42.03 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3710  putative DNA uptake protein  42.03 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3881  putative DNA uptake protein  42.03 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3713  putative DNA uptake protein  42.03 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4233  putative DNA uptake protein  40.58 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0179  putative DNA uptake protein  41.79 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  40.58 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0106  putative DNA uptake protein  38.24 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.790621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  34.21 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2673  HesB/YadR/YfhF-family protein  48.15 
 
 		 199 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3502  putative DNA uptake protein  40.26 
 
 		 192 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.840353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4010  putative DNA uptake protein  40.62 
 
 		 192 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2911  putative DNA uptake protein  41.79 
 
 		 194 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3794  putative DNA uptake protein  38.81 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100459  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0244  putative DNA uptake protein  37.31 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2457  HesB/YadR/YfhF-family protein  37.5 
 
 		 211 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172331  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0220  putative DNA uptake protein  38.46 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.722098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3804  putative DNA uptake protein  39.68 
 
 		 192 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.472358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4003  putative DNA uptake protein  39.68 
 
 		 192 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4619  putative DNA uptake protein  37.31 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3528  putative DNA uptake protein  37.31 
 
 		 192 aa  44.3  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3880  putative DNA uptake protein  39.68 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  44.44 
 
 		 199 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4324  putative DNA uptake protein  37.31 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4125  putative DNA uptake protein  37.31 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0142  putative DNA uptake protein  37.31 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4192  putative DNA uptake protein  37.31 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2293  putative DNA uptake protein  44.62 
 
 		 195 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1491  putative DNA uptake protein  38.89 
 
 		 193 aa  43.9  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241637  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  35.11 
 
 		 242 aa  43.5  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3202  putative DNA uptake protein  42.86 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0161749 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001879  NfuA Fe-S protein maturation  41.98 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2172  thioredoxin-like protein  46.3 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2084  HesB/YadR/YfhF-family protein  46.3 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.92431  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1911  hypothetical protein  32.91 
 
 		 227 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392795  hitchhiker  0.00108913 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03996  putative DNA uptake protein  34.38 
 
 		 192 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2202  HesB/YadR/YfhF  32.91 
 
 		 257 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20209  decreased coverage  0.00866489 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.76 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  36.52 
 
 		 291 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00614  putative DNA uptake protein  40.62 
 
 		 194 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1847  HesB/YadR/YfhF-family protein  33.77 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000308783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>