More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2333 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2333  ABC transporter related protein  100 
 
 
361 aa  734    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  48.27 
 
 
379 aa  317  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  46.81 
 
 
377 aa  311  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  45.96 
 
 
382 aa  309  5e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3225  ABC transporter related  44.8 
 
 
373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711739  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  45.33 
 
 
366 aa  301  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  41.53 
 
 
395 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4396  ABC transporter related protein  45.07 
 
 
385 aa  299  5e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.510739  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2865  ABC transporter related  44.72 
 
 
373 aa  298  8e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  44.63 
 
 
379 aa  297  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  44.63 
 
 
363 aa  297  2e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2486  ABC transporter related  42.13 
 
 
375 aa  297  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.948028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  45.8 
 
 
382 aa  297  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  44.15 
 
 
379 aa  296  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  44.78 
 
 
383 aa  294  1e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  41.62 
 
 
352 aa  294  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2267  ABC transporter related  42.82 
 
 
393 aa  294  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274393  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  42.7 
 
 
364 aa  293  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  41.95 
 
 
395 aa  293  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  42.7 
 
 
364 aa  292  5e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  42.7 
 
 
364 aa  291  8e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  42.7 
 
 
364 aa  291  9e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  42.15 
 
 
355 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  43.06 
 
 
369 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1816  ABC transporter related protein  47.58 
 
 
390 aa  291  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4487  ABC transporter related protein  43.16 
 
 
380 aa  290  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  43.87 
 
 
360 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  43.55 
 
 
368 aa  290  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.21 
 
 
358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  44.26 
 
 
352 aa  289  6e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.71 
 
 
357 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  51.19 
 
 
388 aa  287  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  46.42 
 
 
363 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  41.78 
 
 
356 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.49 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  45.69 
 
 
359 aa  286  4e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  41.1 
 
 
357 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  48.33 
 
 
426 aa  286  5e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.27 
 
 
357 aa  285  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.27 
 
 
357 aa  285  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  42.15 
 
 
375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  40.65 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  43.05 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.99 
 
 
357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  41.32 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.32 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.32 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  41.32 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.32 
 
 
356 aa  282  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  42.27 
 
 
354 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.32 
 
 
356 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  41.19 
 
 
363 aa  281  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  41.05 
 
 
356 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.32 
 
 
356 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  47.28 
 
 
410 aa  280  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.32 
 
 
356 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  43.84 
 
 
358 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.32 
 
 
356 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.05 
 
 
356 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  47.44 
 
 
404 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  45.83 
 
 
406 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.05 
 
 
356 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  44.08 
 
 
352 aa  279  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  39.83 
 
 
357 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  42.31 
 
 
349 aa  279  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  47.37 
 
 
381 aa  278  8e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  42.38 
 
 
356 aa  278  8e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.77 
 
 
356 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  44.48 
 
 
366 aa  277  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  42.43 
 
 
365 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.06 
 
 
379 aa  276  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.5 
 
 
356 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1071  ABC transporter ATP-binding protein  39.67 
 
 
372 aa  276  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.457538  normal  0.825195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
360 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0525  ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 
371 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143614  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  41.37 
 
 
357 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.67 
 
 
356 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  39.78 
 
 
367 aa  275  6e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  39.78 
 
 
367 aa  275  6e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0586  ABC transporter related  39.67 
 
 
371 aa  276  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0376883  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  40.6 
 
 
367 aa  275  7e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5458  ABC transporter related  47.52 
 
 
416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.41 
 
 
351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  41.69 
 
 
367 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  44.72 
 
 
395 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  40.93 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  42.01 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  40.95 
 
 
374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.94 
 
 
376 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  40.98 
 
 
359 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  43.99 
 
 
408 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 
357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  44.81 
 
 
365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  46.5 
 
 
380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.26 
 
 
359 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  41.6 
 
 
356 aa  273  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.32 
 
 
406 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  41.97 
 
 
367 aa  272  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  41.48 
 
 
361 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>