More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2249 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2249  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
329 aa  665    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0264  cytochrome c oxidase, subunit II  61.72 
 
 
343 aa  382  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0785  cytochrome c oxidase, subunit II  52.53 
 
 
258 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.358332  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  42.86 
 
 
351 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  39.73 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  31.78 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  39.73 
 
 
350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  39.73 
 
 
350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  28.5 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  35.44 
 
 
316 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  30.23 
 
 
408 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  29.72 
 
 
405 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  27.57 
 
 
362 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  35.25 
 
 
321 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  29.61 
 
 
330 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  28.03 
 
 
346 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.86 
 
 
311 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  30.48 
 
 
426 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  28.5 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  38.18 
 
 
359 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  26.85 
 
 
249 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  28.92 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  32.14 
 
 
425 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  28.04 
 
 
362 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  26.61 
 
 
318 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  37.17 
 
 
362 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  29.56 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  28.14 
 
 
243 aa  93.6  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  28.5 
 
 
211 aa  92.8  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  39.6 
 
 
389 aa  92.8  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  38.52 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  26.32 
 
 
275 aa  92.4  9e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  26.63 
 
 
329 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  34.51 
 
 
313 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  35.45 
 
 
310 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  26.73 
 
 
300 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  40 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  28.99 
 
 
256 aa  90.1  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  37.29 
 
 
355 aa  89.4  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.45 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  40 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  42.05 
 
 
271 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  29.15 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  27.18 
 
 
272 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  27.5 
 
 
288 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  25.55 
 
 
276 aa  86.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  27.11 
 
 
337 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  33.9 
 
 
360 aa  85.9  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  26.91 
 
 
337 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  29.76 
 
 
346 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  33.63 
 
 
351 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  30.13 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  27.11 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  27.86 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  28.08 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  34.45 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.06 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  31.72 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.25 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  34.65 
 
 
336 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  37.04 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  25.48 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  37.04 
 
 
267 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  27.59 
 
 
434 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  26.05 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  25.96 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.25 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  27.8 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  28.64 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  33.58 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  34.86 
 
 
320 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  26.18 
 
 
274 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  25.31 
 
 
391 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  25.96 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  34.86 
 
 
320 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  33.62 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  28.05 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  29.01 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  26.1 
 
 
528 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  29.3 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  26.73 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  26.73 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  25.51 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  28.3 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  38.54 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  26.07 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  24.43 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  24.43 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  26.18 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  26.07 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  26.73 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  28.96 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  28.48 
 
 
405 aa  79.3  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  26.18 
 
 
270 aa  79  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  28.4 
 
 
288 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  27.27 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>