More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0286 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0286  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 
290 aa  585  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2139  RimK domain protein ATP-grasp  82.44 
 
 
291 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0657  RimK domain protein ATP-grasp  67.59 
 
 
288 aa  390  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  63.3 
 
 
299 aa  360  1e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  61.32 
 
 
289 aa  336  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  28.44 
 
 
335 aa  85.9  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2370  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  30.41 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  28.37 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1581  S6 modification enzyme RimK  32.11 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.683283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.27 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2282  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.11 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  27.75 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.28 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.12 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.8 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.74 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  27.06 
 
 
459 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.05 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  26.29 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  27.36 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  28.08 
 
 
302 aa  75.5  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.11 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  26.15 
 
 
456 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  31.09 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  30.66 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  30.69 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.65 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.63 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  32.99 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.81 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  28.05 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.45 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.22 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  25.62 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  27.59 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  25.75 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  30.3 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.3 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  30.3 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  30.14 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  30.3 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  30.3 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  30.3 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  26.79 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  26.44 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  30.2 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.68 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.68 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.68 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  30.39 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.6 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  26.67 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  25.68 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  28.43 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  25.79 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2232  alpha-L-glutamate ligase  31.53 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109123  hitchhiker  0.00523589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5981  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.56 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.91 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  24.91 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  24.91 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  26.5 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  24.91 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.78 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  26.47 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  24.91 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  29.62 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  26.67 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  27.69 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  27.69 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  26.6 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.5 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  27.09 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  25.99 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  25.22 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  27.84 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.72 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  25.11 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  28.24 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  29.14 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.32 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.69 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.19 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2213  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.01 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  27.93 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.32 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2583  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.01 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.549073  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  22.48 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.21 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  25.91 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  25.22 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.59 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.23 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  28.35 
 
 
301 aa  67  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  28.43 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.32 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.57 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  30.41 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  27.2 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  32.09 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.349493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>