More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5872 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5872  histidine kinase  100 
 
 
717 aa  1376    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
780 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 
516 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
673 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.23 
 
 
365 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0292  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
393 aa  100  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.183452  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  48.57 
 
 
546 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.14 
 
 
369 aa  98.6  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
766 aa  98.2  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  30.34 
 
 
608 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.34 
 
 
608 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  48.41 
 
 
367 aa  97.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  30.34 
 
 
608 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2806  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45 
 
 
361 aa  97.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.69 
 
 
362 aa  97.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  30.34 
 
 
608 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  30.34 
 
 
608 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 
516 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  30.34 
 
 
608 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1404  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.92 
 
 
361 aa  95.9  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  42.24 
 
 
363 aa  95.5  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
510 aa  95.5  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0604  histidine kinase  40.68 
 
 
516 aa  95.9  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1523  putative nitrogen regulation, histidine kinase, protein NR(II)  33.33 
 
 
380 aa  95.5  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000460807  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  32.55 
 
 
912 aa  95.1  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2614  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 
380 aa  95.5  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.082338  normal  0.678018 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
586 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2562  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.76 
 
 
363 aa  94.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 
526 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  42.98 
 
 
560 aa  94.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  36.89 
 
 
499 aa  93.6  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
441 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0352523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1480  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.74 
 
 
380 aa  94  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4002  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
765 aa  93.2  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
497 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
544 aa  92.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
367 aa  92.8  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0387  histidine kinase  34.71 
 
 
356 aa  92.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 
525 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 
525 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2768  nitrogen regulation protein  32.44 
 
 
395 aa  92  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
584 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  35.88 
 
 
573 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2251  nitrogen regulation protein NR(II)  32.44 
 
 
380 aa  91.3  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2633  nitrogen regulation protein NR(II)  32.44 
 
 
380 aa  91.3  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.90491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2689  nitrogen regulation protein NR(II)  32.44 
 
 
380 aa  91.3  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3068  nitrogen regulation protein NR(II)  32.44 
 
 
380 aa  91.3  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1523  nitrogen regulation protein NR(II)  32.44 
 
 
380 aa  91.3  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.65 
 
 
367 aa  91.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1741  nitrogen regulation protein  32.44 
 
 
357 aa  91.3  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.546015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  31.1 
 
 
592 aa  91.3  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1845  nitrogen regulation protein  32 
 
 
395 aa  91.3  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
588 aa  90.9  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  40.14 
 
 
655 aa  90.5  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.84 
 
 
490 aa  90.5  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  33.65 
 
 
600 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1993  two component sensor histidine kinase  31.51 
 
 
366 aa  90.5  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
488 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.75 
 
 
598 aa  90.1  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
422 aa  90.5  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
592 aa  90.5  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
492 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
476 aa  90.5  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  38.89 
 
 
621 aa  89.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
829 aa  89.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
368 aa  89.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3279  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
608 aa  89  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00154728  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1250  histidine kinase  26.48 
 
 
498 aa  89  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.792826  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2058  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.56 
 
 
380 aa  88.6  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.778281  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  34.08 
 
 
367 aa  88.6  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.56 
 
 
380 aa  88.6  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374753  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 
372 aa  88.6  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  37.5 
 
 
487 aa  88.2  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  41.54 
 
 
484 aa  87.8  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
708 aa  87.8  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
518 aa  87.8  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
372 aa  87.8  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 
548 aa  87.8  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
447 aa  87.8  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
497 aa  87.4  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 
1193 aa  87.4  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  39.83 
 
 
830 aa  87  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  31.58 
 
 
614 aa  87  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0096  histidine kinase  31.73 
 
 
525 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
902 aa  87  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5457  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.56 
 
 
380 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
655 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3785  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 
611 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.862005  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  32.39 
 
 
613 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  37.5 
 
 
1836 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5929  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.11 
 
 
380 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
793 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1306  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 
763 aa  87  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147703  normal  0.027228 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2148  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.11 
 
 
380 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 
785 aa  87  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2166  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.11 
 
 
380 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
672 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3869  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 
611 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.793663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1424  sensor histidine kinase KinD  26.48 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
461 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>