46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5327 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  711    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  30.1 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  29.68 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  28.84 
 
 		 416 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  33.07 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  28.16 
 
 		 364 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0737  hypothetical protein  33.43 
 
 		 430 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000826338  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  28.21 
 
 		 374 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  26.42 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0774  hypothetical protein  32.84 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0774  hypothetical protein  32.84 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  27.38 
 
 		 408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  27.43 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  25.5 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  26.93 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  28.08 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  28.37 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  27.79 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  25.6 
 
 		 388 aa  97.4  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  25.44 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  24.85 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  24.56 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0781  hypothetical protein  29.05 
 
 		 394 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.217138 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  24.63 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  25.87 
 
 		 425 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0286  hypothetical protein  25.86 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.0827061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  29.27 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  25.21 
 
 		 553 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  27.62 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1476  hypothetical protein  27.34 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  21.71 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1602  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  28.09 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1799  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  25 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3729  hypothetical protein  22.81 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3029  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  28.06 
 
 		 421 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2423  hypothetical protein  21.46 
 
 		 432 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0419  hypothetical protein  23.33 
 
 		 395 aa  53.1  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  26.19 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3279  hypothetical protein  23.48 
 
 		 407 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710367  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  24.31 
 
 		 870 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1096  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  23.33 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6656  hypothetical protein  22.76 
 
 		 448 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4990  hypothetical protein  22.42 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  25.26 
 
 		 1223 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1149  hypothetical protein  23.04 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  24.64 
 
 		 1222 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>