33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5112 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5112  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  757    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5767  Protein of unknown function DUF2341  29.43 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.71 
 
 		 598 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.63 
 
 		 598 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  27.48 
 
 		 756 aa  94  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  27.48 
 
 		 756 aa  94  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  27.48 
 
 		 756 aa  94  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.22 
 
 		 599 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.51 
 
 		 551 aa  91.3  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.73 
 
 		 603 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.29 
 
 		 594 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.59 
 
 		 671 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.67 
 
 		 680 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.71 
 
 		 607 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.08 
 
 		 585 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  25.67 
 
 		 608 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25 
 
 		 555 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.1 
 
 		 655 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  25.2 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  25.89 
 
 		 555 aa  69.7  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  21.21 
 
 		 1054 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0751  hypothetical protein  40.74 
 
 		 698 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0213879 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.68 
 
 		 1600 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  24.48 
 
 		 1310 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  24.77 
 
 		 4761 aa  49.7  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  25 
 
 		 1367 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1699 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  22.46 
 
 		 4433 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  24.87 
 
 		 1306 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  31.68 
 
 		 2223 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  28.16 
 
 		 6678 aa  43.1  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  23.87 
 
 		 3507 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  34.38 
 
 		 433 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>