34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2577 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  100 
 
 		 446 aa  885    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  44.01 
 
 		 526 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  49.35 
 
 		 473 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  42.36 
 
 		 967 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  35.02 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  41.81 
 
 		 499 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  34.7 
 
 		 554 aa  200  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  32.44 
 
 		 490 aa  199  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  36.81 
 
 		 944 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  36.48 
 
 		 946 aa  190  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  34.09 
 
 		 935 aa  189  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  33.25 
 
 		 930 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  39.59 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  31.24 
 
 		 464 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  36.86 
 
 		 464 aa  169  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  37.96 
 
 		 507 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34 
 
 		 561 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  35.76 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  31.02 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  33.08 
 
 		 525 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  34.02 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  31.94 
 
 		 561 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  36.27 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  32.09 
 
 		 425 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  35.55 
 
 		 533 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  36.04 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  33.93 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 564 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.08 
 
 		 934 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3705  hypothetical protein  29.88 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  34.02 
 
 		 386 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  32.46 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2012  Parallel beta-helix repeat protein  28.68 
 
 		 414 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>