21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2012 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2012  Parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 		 414 aa  811    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.03 
 
 		 934 aa  70.5  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2509  hemolysin-type calcium-binding region  25.07 
 
 		 865 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  30.47 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.55 
 
 		 561 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4525  Parallel beta-helix repeat protein  25.14 
 
 		 488 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000043731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.56 
 
 		 884 aa  49.7  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  38.16 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4720  hypothetical protein  26.75 
 
 		 425 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  37.68 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.21 
 
 		 832 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  36.23 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  39.58 
 
 		 1200 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2363  hypothetical protein  23.81 
 
 		 522 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2772  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.43 
 
 		 853 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000415237  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  41.1 
 
 		 499 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  35.87 
 
 		 561 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  28.68 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  29.81 
 
 		 641 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  36.11 
 
 		 390 aa  44.3  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  30.67 
 
 		 526 aa  43.1  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>