More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2845 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2845  GrpE protein  100 
 
 
219 aa  424  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198977  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  62.8 
 
 
234 aa  197  7.999999999999999e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2014  GrpE protein  43.53 
 
 
361 aa  175  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0658  GrpE protein  53.37 
 
 
410 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1291  GrpE protein  47.98 
 
 
218 aa  143  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  38.03 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  36.11 
 
 
191 aa  95.9  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  35.58 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.88 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  36.09 
 
 
189 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  38.32 
 
 
169 aa  90.5  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  38.85 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  37.69 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  36.73 
 
 
181 aa  89.7  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  34.34 
 
 
178 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  34.34 
 
 
178 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  37.84 
 
 
238 aa  87  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  36.71 
 
 
208 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  36.08 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  33.56 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  37.69 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 
189 aa  85.1  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  35.92 
 
 
207 aa  85.1  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  36.03 
 
 
194 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  33.33 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  31.28 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  35.34 
 
 
199 aa  82  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.88 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  34.31 
 
 
282 aa  81.6  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  33.85 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.5 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  33.09 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  35 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  39.06 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  32.96 
 
 
180 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1459  GrpE protein  35.21 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  35.82 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  33.52 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  31.28 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.54 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  32 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  30.26 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  36.69 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  34.71 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  33.08 
 
 
198 aa  79  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  34.85 
 
 
200 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  35.19 
 
 
230 aa  79  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  35.19 
 
 
230 aa  79  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  35.82 
 
 
202 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  35.43 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  31.51 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  31.44 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  32.24 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  29.91 
 
 
261 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  33.73 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  35.17 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  36.15 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  33.13 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  32.24 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  29.91 
 
 
261 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2457  GrpE protein  30.85 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.23302  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  30.05 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  33.57 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  27.81 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  34.57 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  36.15 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  31.79 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.88 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  31.38 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  31.38 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  31.38 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  31.38 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  32.24 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  31.38 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  33.99 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  34.65 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  31.74 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  33.57 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  33.1 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  34.86 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  30.43 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  31.38 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  31.38 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  35.33 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  31.14 
 
 
181 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>