More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1506 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0547  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  86.29 
 
 		 425 aa  749    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0281  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  89.65 
 
 		 425 aa  781    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.398355  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1506  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  100 
 
 		 425 aa  860    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2939  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  75.77 
 
 		 434 aa  657    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2330  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  72.92 
 
 		 420 aa  629  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01134  isocitrate dehydrogenase  51.54 
 
 		 416 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.54 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1315  isocitrate dehydrogenase  51.54 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1256  isocitrate dehydrogenase  51.54 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00899143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  51.54 
 
 		 416 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2396  isocitrate dehydrogenase (NADP)  50.24 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286181  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01142  hypothetical protein  51.54 
 
 		 416 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  51.54 
 
 		 416 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2467  isocitrate dehydrogenase  51.54 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  51.78 
 
 		 416 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1288  isocitrate dehydrogenase [NADP]  49.76 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1649  isocitrate dehydrogenase  50.71 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0964571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2128  isocitrate dehydrogenase  51.19 
 
 		 416 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573381 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1339  isocitrate dehydrogenase  51.19 
 
 		 416 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.697532  normal  0.0115036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1946  isocitrate dehydrogenase  51.19 
 
 		 416 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1349  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.53 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3415  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.82 
 
 		 418 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  50.83 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2025  isocitrate dehydrogenase  50.83 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.64 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0310087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2584  isocitrate dehydrogenase  49.53 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3593  isocitrate dehydrogenase (NADP)  48.82 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1355  isocitrate dehydrogenase  50.95 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.485597 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2245  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.12 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000403811  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1945  isocitrate dehydrogenase  50.95 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1264  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.1 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  50.83 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30190  isocitrate dehydrogenase  49.53 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1317  isocitrate dehydrogenase  50.95 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1615  isocitrate dehydrogenase  50.83 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1840  isocitrate dehydrogenase  48.34 
 
 		 419 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2157  isocitrate dehydrogenase  50.48 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0640579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1872  isocitrate dehydrogenase  50.48 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2348  isocitrate dehydrogenase  48.28 
 
 		 432 aa  411  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2060  isocitrate dehydrogenase  50.24 
 
 		 417 aa  408  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.714189  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3616  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.82 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.133268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.28 
 
 		 586 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1822  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.34 
 
 		 418 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.083178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4011  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.34 
 
 		 418 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.120573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1950  isocitrate dehydrogenase (NADP)  45.82 
 
 		 481 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.05 
 
 		 589 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  50.47 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0021  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.52 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0878  isocitrate dehydrogenase  48.11 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0849  isocitrate dehydrogenase  48.11 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0854  isocitrate dehydrogenase (NADP)  47.87 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.515822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.35 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  50.12 
 
 		 423 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2139  isocitrate dehydrogenase (NADP)  49.29 
 
 		 413 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000111217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2756  isocitrate dehydrogenase  48.1 
 
 		 416 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0314  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.11 
 
 		 419 aa  395  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.839134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2895  isocitrate dehydrogenase  48.58 
 
 		 416 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.328131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1908  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.8 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0378  isocitrate dehydrogenase  47.43 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2942  isocitrate dehydrogenase  46.45 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1930  isocitrate dehydrogenase  46.21 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1166  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  45.99 
 
 		 420 aa  391  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0452  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  44.84 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173819  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3119  isocitrate dehydrogenase (NADP)  48.22 
 
 		 413 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2769  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.75 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3661  isocitrate dehydrogenase  47.52 
 
 		 420 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1562  isocitrate dehydrogenase  45.86 
 
 		 419 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.89 
 
 		 411 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0565  isocitrate dehydrogenase  46.21 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000686773  decreased coverage  0.000103322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2490  isocitrate dehydrogenase  45.97 
 
 		 416 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1684  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.21 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1261  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.52 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2297  isocitrate dehydrogenase  45.63 
 
 		 419 aa  385  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351069  normal  0.0198285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1378  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  45.52 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5856  isocitrate dehydrogenase  45.99 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261017  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0797  isocitrate dehydrogenase  46.23 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000273834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2549  isocitrate dehydrogenase  45.99 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0115447  hitchhiker  0.0000544039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2071  isocitrate dehydrogenase  44.05 
 
 		 475 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00869667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1913  isocitrate dehydrogenase  45.99 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3277  isocitrate dehydrogenase  50.35 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2572  isocitrate dehydrogenase  45.99 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2443  isocitrate dehydrogenase  45.99 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000919661 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2524  isocitrate dehydrogenase  45.99 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2572  isocitrate dehydrogenase  46.1 
 
 		 419 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0647268  decreased coverage  0.00287604 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  45.75 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4724  isocitrate dehydrogenase  49.65 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4703  isocitrate dehydrogenase  49.65 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4838  isocitrate dehydrogenase  49.65 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4719  isocitrate dehydrogenase  49.65 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0535  isocitrate dehydrogenase  49.65 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0195794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2468  isocitrate dehydrogenase  45.02 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240334  normal  0.106657 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0960  isocitrate dehydrogenase  45.63 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.607193  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0586  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.85 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0956  isocitrate dehydrogenase  45.39 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0812619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0132  isocitrate dehydrogenase  45.63 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1785  isocitrate dehydrogenase  45.18 
 
 		 422 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0424  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.85 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4708  isocitrate dehydrogenase  49.65 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2349  isocitrate dehydrogenase  45.73 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297968  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1015  isocitrate dehydrogenase  45.63 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.575855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>