48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0552 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  663    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  58.11 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  52.06 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  53.89 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  52.96 
 
 		 336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  51.79 
 
 		 329 aa  258  8e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  34.33 
 
 		 234 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  31.43 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  32.46 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  29.35 
 
 		 225 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  29.63 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  36.79 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  32.83 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  27.94 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  30.39 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  31.93 
 
 		 224 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  32.95 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  27.18 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  31.44 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  33.5 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  31.66 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  32.81 
 
 		 377 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  29.37 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  29.67 
 
 		 218 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  27.78 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  29.22 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  25.58 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  30.56 
 
 		 267 aa  50.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3129  hypothetical protein  30.28 
 
 		 322 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  27.3 
 
 		 502 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  28.21 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  29.49 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  29.79 
 
 		 444 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  27.96 
 
 		 502 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  31.82 
 
 		 366 aa  46.2  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  28.29 
 
 		 442 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  26.61 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  35 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  35.71 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  35.54 
 
 		 470 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  27.93 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  30.17 
 
 		 216 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  29.86 
 
 		 392 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  29.86 
 
 		 392 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0405  FHA domain containing protein  26.03 
 
 		 490 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  32.03 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4020  hypothetical protein  33.7 
 
 		 335 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  29.86 
 
 		 392 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>