34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1937 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1937  putative pseudouridylate synthase  100 
 
 		 427 aa  849    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1624  THUMP domain protein  64.99 
 
 		 438 aa  547  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.443715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0986  putative pseudouridylate synthase  65.18 
 
 		 449 aa  547  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2703  hypothetical protein  61.12 
 
 		 453 aa  518  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.120087  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0740  pseudouridylate synthase-like protein  62.41 
 
 		 457 aa  521  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3230  putative pseudouridylate synthase  43.15 
 
 		 431 aa  360  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000174265  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0546  putative pseudouridylate synthase  46.6 
 
 		 409 aa  352  8e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0278451  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0906  putative pseudouridylate synthase  43.58 
 
 		 428 aa  348  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000179406  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1875  putative pseudouridylate synthase  45.56 
 
 		 410 aa  346  5e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.451717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1962  putative pseudouridylate synthase  45.39 
 
 		 412 aa  343  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3025  putative pseudouridylate synthase  41.49 
 
 		 415 aa  333  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1567  putative pseudouridylate synthase  42.72 
 
 		 411 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.659369  normal  0.0108889 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0643  THUMP domain protein  39.45 
 
 		 383 aa  286  7e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0992  putative pseudouridylate synthase  40.09 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0853  putative pseudouridylate synthase  37.2 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1093  putative pseudouridylate synthase  37.47 
 
 		 469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0712326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1582  putative pseudouridylate synthase  36.8 
 
 		 470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.640324  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0354  pseudouridylate synthase  34.27 
 
 		 444 aa  231  1e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1254  putative pseudouridylate synthase  36.8 
 
 		 481 aa  231  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.367648  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1106  putative pseudouridylate synthase  37.28 
 
 		 474 aa  229  7e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0599  putative pseudouridylate synthase  32.05 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00101881  hitchhiker  0.0000193518 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1724  putative pseudouridylate synthase  32.21 
 
 		 411 aa  189  5e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.86816 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1517  putative pseudouridylate synthase  31.98 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1771  putative pseudouridylate synthase  31.08 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.524292  hitchhiker  0.0084243 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29419  predicted protein  33.71 
 
 		 276 aa  116  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.444552  hitchhiker  0.00250662 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0532  pseudouridylate synthase-like protein  21.96 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0954  hypothetical protein  24.39 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45108  predicted protein  29.19 
 
 		 571 aa  79  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1951  conserved hypothetical protein  22.46 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1758  putative pseudouridylate synthase  25.87 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.293188 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  33.03 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  35.14 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  33.94 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0797  heat shock protein DnaJ domain protein  27.73 
 
 		 369 aa  44.7  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.95295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>