More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1630 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1630  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
68 aa  136  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.327142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2850  cold-shock DNA-binding domain protein  80.88 
 
 
65 aa  111  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1855  cold-shock DNA-binding domain protein  80.88 
 
 
64 aa  111  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1986  cold-shock DNA-binding domain protein  82.09 
 
 
64 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.320623 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1312  cold-shock DNA-binding domain protein  83.58 
 
 
64 aa  108  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.632587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0048  cold-shock DNA-binding domain protein  79.41 
 
 
64 aa  107  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152198  hitchhiker  0.00109076 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 
64 aa  106  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0430  cold-shock DNA-binding domain protein  79.1 
 
 
64 aa  106  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3545  cold-shock DNA-binding domain protein  77.94 
 
 
64 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2592  cold-shock DNA-binding domain protein  77.94 
 
 
64 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00103043  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0386  cold-shock DNA-binding domain protein  89.71 
 
 
78 aa  105  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0647  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 
69 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0554  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 
64 aa  103  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 
64 aa  103  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1549  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 
64 aa  101  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0661  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 
64 aa  101  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.90481  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1326  cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 
64 aa  101  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706189  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1585  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 
64 aa  100  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0339  cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 
64 aa  100  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.219193 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1550  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 
64 aa  100  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1421  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 
64 aa  100  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2827  cold-shock DNA-binding domain protein  80.6 
 
 
64 aa  90.5  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2828  cold-shock DNA-binding domain protein  79.1 
 
 
64 aa  89  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.272905  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3576  cold-shock DNA-binding domain protein  79.1 
 
 
64 aa  87.8  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0493  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.57 
 
 
66 aa  66.6  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156279  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1440  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.71 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  50.72 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.14 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  47.14 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  47.14 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.29 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0880  cold shock protein  44.29 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000035682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2200  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.57 
 
 
66 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000689795  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  44.29 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0073  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
67 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.621224  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  45.71 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  45.71 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  45.71 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  45.71 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  45.71 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  45.71 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  45.71 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.07 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  45.71 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  45.71 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.71 
 
 
66 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07120  cold-shock DNA-binding protein family  50 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976007  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.07 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2466  cold shock-like transcription regulator protein  47.06 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.4868  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  48.53 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.71 
 
 
66 aa  60.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  47.06 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114675  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2588  cold-shock DNA-binding domain protein  47.06 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.110334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1274  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.06 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4380  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.29 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3185  cold-shock DNA-binding domain protein  45.71 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000997397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4020  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.29 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000184454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  45.07 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  45.07 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  44.29 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000080188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  45.07 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  45.07 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  43.48 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.93 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.59 
 
 
72 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  44.93 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5000  cold shock protein  44.93 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  44.93 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  45.07 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  45.07 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1077  cold-shock DNA-binding domain protein  45.71 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27833e-32 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  45.07 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  45.71 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.463030000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.12 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.06 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.06 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1740  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.93 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183326  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.86 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  45.07 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.06 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1502  cold-shock DNA-binding domain protein  44.29 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3711  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.29 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000509741  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0387  cold-shock DNA-binding domain protein  45.59 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000327706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.07 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  44.29 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  45.71 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.12 
 
 
67 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  44.29 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0340  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.29 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.6796e-20  unclonable  6.2466300000000005e-24 
 
 
 
NC_007760  Adeh_1235  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.14 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2630  cold-shock DNA-binding domain protein  47.14 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.681724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2724  cold-shock DNA-binding domain protein  47.14 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720009  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0555  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.71 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.29 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0979697  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  45.07 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.71 
 
 
65 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.86 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1750  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.59 
 
 
67 aa  57.8  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0957427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1452  cold shock protein  49.28 
 
 
69 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00528727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.59 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>