63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4568 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4568  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  287  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0923451  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  21.85 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  21.85 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  21.85 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  34.29 
 
 		 328 aa  45.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 262 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 206 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  32.81 
 
 		 262 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  32.81 
 
 		 262 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 327 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 459 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  32.53 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  35 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  34.55 
 
 		 262 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  32.53 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  36.67 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  34.62 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  38.78 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 64 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  28.28 
 
 		 383 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 64 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  40.3 
 
 		 293 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  38 
 
 		 144 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  34.43 
 
 		 149 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  35 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  32.18 
 
 		 347 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  42 
 
 		 247 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  43.48 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  38.18 
 
 		 368 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 229 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2350  helix-turn-helix domain-containing protein  34.85 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  26.96 
 
 		 221 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  35.85 
 
 		 235 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  36.07 
 
 		 436 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0653  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0234268  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 221 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  31.34 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  35 
 
 		 358 aa  40.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  33.82 
 
 		 359 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  28.3 
 
 		 205 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>